脉冲场凝胶电泳技术在本草基因组计划中的应用元 - 世界科学技术-中 .pdf

2010 第十二卷 第三期 Vol.12 No.3 脉冲场凝胶电泳技术 在本草基因组计划中的应用元 阴刘明珠元元 白志川 （西南大学园艺园林学院 重庆 400716 ） 陈士林 孙 超元元 何 柳 张 进 中国医学科学院 （ 药用植物研究所 北京 100193） 北京协和医学院 ： （ ，包括测定药用真 要 本文着重介绍了脉冲场凝胶电泳 PFGE ）在本草基因组测序中的应用 菌染色体数目和基因组大小、构建基因组文库及绘制物理图谱，并对 PFGE 使用中一些待解决的问题 做了简要介绍。 关键词：PFGE 本草基因组计划 基因组大小 基因组文库 物理图谱 doi: 10.3969/j .issn.1674-3849.2010.03.028 ，是中华民族的无 （ 中医药是中国传统国粹之一 脉冲场凝胶电泳技术 Pulsed Field Gel Elec原 价瑰宝，受到国内外医药与科技界的广泛关注。然而 trophoresis,PFGE ）是以分离大片段线型 DNA 分子 中医药学基础研究工作起步较晚，加强中医药基础 （50kb~12Mb ）为目的的一种非常成熟的电泳技术，也 研究，已成为21 世纪中医药事业发展内在的迫切需 是本草基因组计划实施过程中必需的技术手段。 求。近年来，随着新一代测序技术即高通量测序技术 一、PFGE 原理及方法 的发展，物种的De Novo 全基因测序变得更加 速、 便捷，此时本草基因组计划的启动，必将为我国中医 本草基因组De Novo 测序是一项非常复杂的工 药事业的国际化发展起到巨大的推动作用。该计划 作，需要使用到大量的仪器设备和技术手段，脉冲场 的运作不仅有利于我国中药研究水 的全面提升， 凝胶电泳技术 （Pulsed Field Gel Electrophoresis ， 而且在物种鉴定、栽培育种、关键酶基因的发掘、活 PFGE ）是其中使用较多也较重要的技术之一，经过多 、合成以及 ， ，箝 性化学成分分离及药理毒理学药物研发 年不断的发展和进步 PFGE 已发展出多种类型 生物转化、天然药物的产业化等方面都将有深入广 位匀强电场技术 （Contour -Clamped Homogeneous 泛的应用。 Electric Field ，CHEF ）是现在用于微生物电泳核型分 析和DNA 大小测定等领域最受欢迎和应用最为广泛 收稿日期：2010-06-02 的一种。 修回日期：2010-06-12 （ （ ，负责人：罗红 。 元 国家自然科学基金面上项目：基于宏量ESTs 的蛇足石杉转录组分析及石杉碱甲合成酶 HAS ）基因的鉴定研究 梅 ： ，主要研究方向：植物 ，