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利用转录组测序技术鉴定紫花苜蓿根系盐胁迫应答基因 - 核农学报
1470 核 农 学 报 2016,30(8):1470 ~1479
Journal of NuclearAgricultural Sciences
文章编号:1000⁃8551(2016)08⁃1470⁃10
利用转录组测序技术鉴定紫花苜蓿
根系盐胁迫应答基因
马 进 郑 钢
(浙江农林大学风景园林与建筑学院,浙江 临安 311300)
摘 要:盐害是影响紫花苜蓿生产力的主要非生物因素之一,鉴定控制这一复杂性状的基因将为苜蓿育
种计划提供关键信息。 为揭示紫花苜蓿在盐胁迫下基因表达谱的变化,以紫花苜蓿Millennium为材料,
对正常培养(WT_CK1)和盐胁迫(WT_N1)条件下的2 个样品根系进行转录组分析,同时利用实时荧光
定量PCR(qRT⁃PCR)技术对部分关键基因的表达特点进行验证。 结果表明,紫花苜蓿根系在250 mM
NaCl胁迫72 h 时,共检测到31907 个基因表达量发生了改变,2 758 个基因的表达量差异达到2倍以
上,包括199 个转录因子,其中1338 个表达量上调,1420 个表达量下调,这些差异表达基因功能主要
涉及次生代谢、代谢途径、激素代谢及信号转导和植物病原菌互作等。 qRT⁃PCR分析表明,6 个随机选
择的基因在胁迫前后的表达特点与表达谱测序结果一致。 综上,紫花苜蓿根系对盐胁迫响应是一个多
基因参与、多个生物代谢过程反应协同调控的过程,基因表达量的变化可能是调控的主要方式。 此外,
+
本研究候选了一系列胆汁酸:Na 共转运蛋白、晚期胚胎发生富集蛋白、谷胱甘肽-s-转移酶基因和转
录因子等与紫花苜蓿盐胁迫相关的应答关键基因,为揭示紫花苜蓿耐盐分子机制奠定了基础。
关键词:紫花苜蓿;盐胁迫;转录组测序;差异表达基因
DOI:1011869/ j.issn.100⁃8551201608.1470
2
全球目前盐渍化土地约有955亿hm ,亚洲因盐 紫花苜蓿(Medicago sativa L.)主要分布在温带地
2[1]
碱化减产的土地有 1亿 hm 。 在我国,各种盐渍化 区,是世界上最重要的豆科牧草之一,因其高营养价值
2
土地面积约01亿hm ,占总耕地面积的7%。 在可耕 和高产等特性,有“牧草黄金”之称。 紫花苜蓿是对高
地面积不断减少而人口不断增长的形式下,如何解决 浓度盐分敏感的甜土植物,耐盐能力有限。 在盐胁迫
土地盐渍化的问题显得尤其重要。 因此,提高作物的 条件下,植物启动众多基因响应,目前已经获得部分盐
耐盐性,培育适合在盐碱地生长的植物品种是有效利 [4]
胁迫下紫花苜蓿耐盐基因。 Miller等 克隆出紫花苜
用盐渍化土地的主要方法。 蓿MsPDH 和MsP5CDH 2 个脯氨酸脱氢酶基因,它们
由于植物自身不能移动,在长期的自然进化中形 [5]
具有增加游离脯氨酸积累的功能;Luo 等 利用 RT⁃
成一系列复杂的调控机制来感受外部胁迫并传递信 PCR从紫花苜蓿中分离得到受胁迫诱导
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