鲤胰蛋白酶原基因的电子克隆及生物信息学分析 - 水产学报.pdf

水产学报 第 卷第 期 年 月 文章编号 鲤胰蛋白酶原基因的电子克隆及生物信息学分析 陈文波 李卫国赵亚军 河南理工大学资源环境学院生物系河南 焦作 摘要 为深入研究胰蛋白酶在鱼类中的生理功能和作用机制 利用生物信息学的方法 成功获得 了鲤 种胰凝乳蛋白酶原 序列 和 并对其进行了序列分析 结 果表明 三者均含有一个长度为 的开放阅读框 编码由 个 氨基酸组成的胰蛋白酶原其中包括 个氨基酸组成的信号肽和 个氨基酸组成的 激活肽 总平均亲水性 分析表明三者均是亲水性蛋 白 氨基酸比对结果显示 三者具备胰蛋白酶原的保守结构特征 如含有催化三联体氨基酸 和 个半胱氨酸位于底物结合口袋底部 和口袋开口处的 等 同时鲤 种胰蛋白酶之间具有 以上的同源性 进化树结果显示鲤 种胰蛋白酶均属于 阴离子型胰蛋白酶 且三者的进化距离不一致 关键词 鲤 胰蛋白酶原 表达序列标签 生物信息学 中图分类号 文献标识码 胰蛋白酶 是由胰腺腺泡 与哺乳类结构类似同样具有保守功能区域 但 细胞分泌的一种重要蛋白酶属于丝氨酸蛋白酶类 是也有差别如鱼类胰蛋白酶的催化效率远高于 超家族 和 形成催化三 哺乳动物等 联体特异性切割多肽链中赖氨酸和精氨酸残基中 随着生物信息学的发展越来越多物种的基因 羧基端参与形成的肽键 在胰腺中胰蛋白酶以 组文库或同一物种不同组织的文库已被构 非活性酶原的形式被合成和分泌进入小肠后在 建同时部分物种的全基因组序列也已完成测序 有 的环境中被肠激酶激活 切割除去 端 这些庞大的序列信息储存使得电子克隆技术成为 的酸性激活肽转变成有活性的胰蛋白酶 产生的 可能 所谓电子克隆 是一种基 胰蛋白酶不仅可以激活胰脏产生的其它蛋白酶如 于表达序列标签 和 胰凝乳蛋白酶原弹性蛋白酶原及羧肽酶原等同 基因组数据库利用计算机来协助克隆基因的方 时还可以激活自身的胰蛋白酶原 法 其基本路线是以一条序列作为探针检索