推定第四类羊毛硫素合成酶生物信息学分析.pdf

微生物学通报 Nov. 20, 2016, 43(11): 2464−2472 Microbiology China /wswxtbcn tongbao@ DOI: 10.13344/j.microbiol.china.151050 研究报告 推定第四类羊毛硫素合成酶生物信息学分析 胡彦婷1,2,3 安丽康2,3 尹淑丽2,3 程辉彩2,3 张根伟2,3 张丽萍2,3 刘洪伟2,3* (1. 300000) (2. 050081) (3. 050081) 摘 要：【目的】获得更多关于第四类羊毛硫素合成酶的序列及蛋白结构特征信息，并为研究 其作用机制及生物学功能奠定基础。【方法】应用多种软件分析和预测了山丘链霉菌、枯草芽 孢杆菌、肺炎双球菌、惰性乳杆菌、德氏乳杆菌、长双歧杆菌、拟无枝酸菌、大芬戈尔德菌中 此类蛋白质的理化性质、结构域、二级结构等，同时采用邻位连接法对这8 种蛋白及其结构域进 行了进化树的构建。【结果】所研究的这8 种蛋白均为亲水性蛋白，均无信号肽；山丘链霉菌、 枯草芽孢杆菌、肺炎双球菌、德氏乳杆菌、长双歧杆菌、拟无枝酸菌、大芬戈尔德菌的此类合成 酶属于酸性蛋白，惰性乳杆菌的类第四类羊毛硫素合成酶属于碱性蛋白；除山丘链霉菌、枯草芽 孢杆菌、肺炎双球菌的此类合成酶不稳定外，其它菌株的合成酶均稳定；进化结果表明枯草芽孢 杆菌和肺炎链球菌同源性最高，LANC-like 结构域与合成酶的进化关系保持了高度的一致，而 STYKc/S_TKc 结构域的进化关系表现出了一定的差异；二级结构主要以α螺旋和无规卷曲为主； 所有的蛋白均有LANC-like 结构域。【结论】类第四类羊毛硫素合成酶在不同的菌种中具有一定 的保守性，因此能够发挥相似的生物学功能。研究结果对进一步研究第四类羊毛硫素合成酶具有 一定的参考价值，尤其是为通过该途径进一步提高枯草芽孢杆菌生防价值提供基础。 关键词：类第四类羊毛硫素合成酶，生物信息学，枯草芽孢杆菌 Bioinformatics to predict type IV lanthipeptide synthetases HU Yan-Ting1,2,3 AN Li-Kang2,3 YIN Shu-Li2,3 CHENG Hui-Cai2,3 ZHANG Gen-Wei2,3 ZHANG Li-Ping2,3 LIU Hong-Wei2,3* (1. Hebei University of Technology, Tianjin 300000, China) (2. Institute of Biology , Hebei Academy of Science, Shijiazhuang, Hebei 050081, China) (3. Main Crops Disease of Microbial Control Engineering Technology Research Center in Hebei Province, Shijiazhuang, Hebei 050081, China) Foundation item: Key Basic Research Project in Hebei Province (No.); Key Projects of Hebei Academy of Sciences (No. 15302); Science and Technology Cooperation and Development Funding Projects of Hebei Provinc