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林学园艺园林3 - 中国农学通报
中国农学通报 2017,33(12):82-87
Chinese Agricultural Science Bulletin
苦瓜果实商品成熟期均一化全长cDNA文库的构建及分析
韩小霞,胡新军,李勇奇,袁祖华,粟建文
(湖南省蔬菜工程技术研究中心/湖南省蔬菜研究所,长沙410125 )
摘 要:为构建苦瓜果实商品成熟期的cDNA 文库,并对相关EST 进行序列分析,笔者以多肽二号苦瓜亲
本‘189-4 ’商品成熟期果实为材料,利用SMART 技术构建其果实的cDNA 文库。经检验该文库库容量
6
为2.08×10 ,重组率为96.29% ,平均插入片段750~2000 bp ,插入片段平均大小约1000 bp 。随机挑取400
个单克隆进行测序,共获得370 条EST ,序列分析结果表明350 条有同源性,全长率为70% ;19条序列无
匹配,单一序列为320 条,其中,片段重叠群10 个,单基因260 个,可能与营养品质相关的基因有48 个。
本研究为苦瓜果实功能基因的筛选、克隆奠定了基础。
关键词:苦瓜;果实;全长cDNA 文库;均一化;EST 分析
中图分类号:S642.5 文献标志码:A 论文编号:cas
ConstructionandAnalysisofNormalizedFull-lengthcDNALibraryof
BitterMelonFruitinGoodsMaturePeriod
HanXiaoxia,HuXinjun,LiYongqi,YuanZuhua,SuJianwen
(TheVegetableEngineeringTechnologyResearchCenterofHunanProvince/
HunanVegetableResearchInstitute,Changsha410125)
Abstract:Inordertoconstructafull-lengthcDNAlibraryofbittermelonfruit in goodsmatureperiodand
analyzethesequenceofEST,inthisresearch,weconstructedafull-lengthcDNAlibraryofbittermelonfruit
forpolypeptidebittermelonparent ‘189-4’ingoodsmatureperiodusingtheSMARTtechnology.Thetested
resultsshowedthatthecapacityofthelibrarywas 2.08×10,restructuringatarateof 96.29%,theaverage6
insertionfragmentrangedfrom 750 to 2000 bp,andtheinsertfragmentaveragesize was about 1000bp.By
sequenced400monoclonalrandomly,wegot370ESTandthesequenceanalysisresultsshowedthat350hada
homology,fulllengthratewas 70%; 19sequencehadnomatching, 320wasunigene,amongthemtherewere
10 contigs, 260 singlegenes,andtherewereabout 48 genespossibly relatedtothenutritionquality.This
researchlaidafoundationforthescreening,cloningoffunctionalgenesforthebittermelon.
Keywords:bittermelon;fruit;full-lengthcDNAl
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