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水牛、大额牛和牦牛抑制素α 亚基编码基因外显子1 多态性分析.pdf

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水牛、大额牛和牦牛抑制素α 亚基编码基因外显子1 多态性分析

动 物 学 研 究 2012, Aug. 33(4): 402−408 CN 53-1040/Q ISSN 0254-5853 Zoological Research DOI: 10.3724/SP.J.1141.2012.04402 水牛、大额牛和牦牛抑制素 α亚基编码基因 外显子 1 多态性分析 1,#,* 1,# 1 1 2 2 苗永旺 , 哈 福 , 高华山 , 袁 峰 , 李大林 , 袁跃云 (1. 云南农业大学 动物科学技术学院分子遗传学实验室, 云南 昆明 650201; 2. 云南省家畜改良工作站, 云南 昆明 650225) 摘要: 为了揭示牛科物种INHA 基因的遗传特征, 该文采用 PCR 产物直接测序法对水牛、大额牛和牦牛INHA 基因外显子 1 及其侧翼序列进行多态性检测, 并结合已发表的包括牛科物种在内的一些哺乳动物数据进行了比较 分析。结果表明, 在水牛 INHA 基因外显子 1 中存在c.73CA 替换, 为同义替换, 河流型和沼泽型水牛编码产物一 致; 在大额牛的 INHA 基因外显子 1 中发现c.62 CT、c.187 GA 替换, 分别引起 INHA 中氨基酸发生p. P21L 、 p. V63M 改变, 两者均为相同性质氨基酸的替换; 在牦牛中发现 c.62 CT、c.129AG 替换, 前者也引起编码氨基 酸发生 p. P21L 替换, 后者为同义替换。在 INHA 基因 5侧翼区所测出的序列中, 水牛、大额牛和牦牛等物种内均 未发现SNP 位点, 但在种间发现存在c. -6TG 的替换, 大额牛、牦牛和普通牛均为c. -6G, 而水牛为c. -6T 。在INHA 基因内含子中, 水牛的第31~36 位核苷酸处发现有6 个碱基的缺失, 即c. 262+31_262+36delTCTGAC; 该位点在河 流型水牛中野生型(+/+) 占主体, 而在沼泽型水牛中则缺失型(-/-) 占主体。在大额牛、牦牛和普通牛等其它牛科物 种的内含子中均未发现该缺失, 但与水牛相比, 大额牛、牦牛和普通牛内含子中发现缺失 c. 262+78_262+79delTG 。 序列比对显示, INHA 基因外显子 1 序列中 c. 43A 和 c. 67G 为水牛中所特有, 而 c. 173A 和 c. 255G 为大额牛、 牦牛和普通牛所共有, c. 24C、c. 47G、c. 174T 和 c. 206T 为山羊所特有。大额牛、牦牛和普通牛间INHA 基因外 显子 1 序列差异较小, 而山羊和水牛与它们间的差异相对较大。 关键词: 水牛; 大额牛; 牦牛; 抑制素 α亚基基因(INHA )外显子 1; 多态性 中图分类号: S823.8;Q75 文献标志码: A 文章编号: 0254-5853-(2012)04-0402-07 Polymorphisms of inhibin α gene exon 1 in buffalo (Bubalus bubalis), gayal (Bos frontalis) and

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