不同物种间乙酰辅酶a 羧化酶的差异性和相似性 - 兰州大学.pdf

第49 卷 第5 期 兰 州 大学学报 （自然科学版） Vol. 49 No. 5 2013 年10 月 Journal of Lanzhou University (Natural Sciences) Oct. 2013 文章编 号: 0455-2059(2013)05-0682-06 不 同物种间乙酰辅酶A 羧化酶的差异性和相似性 1,2 1 1 1 李 阳 , 孔维宝 , 牛世 全 , 武国凡 1. 西北师 范 大 学生 命科学学院, 兰州 730070 2. 中国科学院 遗 与发 育 生物学研 究所, 北 京 100101 摘 要: 采用生 物信 息 学方法 对GenBank, SwissProt 中 的拟 南 芥、大 豆、甘 蓝 型油 菜、小 麦等物种的乙酰辅 酶A 羧化 酶核 苷酸和 氨 基酸序 列 进行了 比对分 析, 进而 对其组成成 分、理化 性 质、疏 水 性/亲 水 性、跨 膜 结构 域、蛋白质 二级结构、功 能结构域、三级结构数进行了预测和 分析. 结果表明: ACC 基因具有 完整的开放阅读 框, 长 约50 683 bp, 编码氨 基酸相对分 子质量为 93.41 kD, 理论等电点为 7.27, 是 亲 水 性不 稳 定蛋白, 二级结构 均以 α–螺旋和 不 规则 卷 曲为主 要构 件. 通 过进化 树 分 析 可 分别将 8 种生 物分 为 2 组: A 支包 括 小 麦等7 个 物 种, B 支仅 含 甘蓝 型油 菜. 关键词: 乙酰辅酶A 羧化 酶; 差异性; 相似 性; 物种; 生物信 息学 中图分类号: Q554; Q518 文献标识码: A Difference and similarity analysis of acetyl-CoA carboxylase between different species 1, 2 1 1 1 LI Yang , KONG Wei-bao , NIU Shi-quan , WU Guo-fan 1. School of Life Sciences, Northwest Normal University, Lanzhou 730070, China 2. Institute of Genetics and Developmental Biology, Chinese Academy of Sciences, Beijing 100101, China Abstract: The nucleic acid sequence and amino acid sequence of acetyl-CoA carboxylase (ACC) from Ara- bidopsis thaliana, Glycine max, Brassica napus, and Triticum aestivum, which were registered in GenBank and SwissProt, were analyzed and predicted with the tools of bioinformatics in the following main aspects, i.e. the composition of nucleic acid sequence and amino acid sequence, physical and chemical characters, hydrophobicity or hydrophilicity, transmembrane topologieal structure, secondary structure of protein, funct