类猪圆环病毒因子p1 vp2 蛋白二级结构与b细胞表位预测 - 华北农学报.pdf

华北农学报 ·2 0 0 9 , 2 4 ( 5 ) : 4 54 9 类猪圆环病毒因子 P1 VP2 蛋白二级结构 与 B 细胞表位预测 1 1 2 3 温立斌 ,何孔旺 ,杨汉春 ,王玉然 ( 1. 江苏省农业科学院 兽医研究所 ,农业部动物疫病诊断与免疫重点开放实验室 , 国家兽用生物制品工程技术研究 中心 ,江苏 南京 　210014 ;2 . 中国农业大学 动物医学院 ,农业部预防兽医学重点开放实验室 ,北京 　100094 ; 3 . 河北省动物卫生监督所 ,河北 石家庄 　050081) 　　摘要 : 旨为预测类猪圆环病毒因子 P1 VP2 蛋白的B 细胞表位 。采用生物信息软件和互联网服务器 ,预测 VP2 的 ( ) 二级结构 ,分析 VP2 表面特性 亲水性 、可塑性 、可及性和抗原性 ,综合预测 VP2 的B 细胞抗原表位 。结果表明 ,P1 VP2 蛋白肽链的6 - 18 和 80 - 92 区段为预测的B 细胞表位优势区。多参数方案综合预测 P1 VP2 蛋白的B 细胞抗原 表位 ,为进一步鉴定表位及设计疫苗奠定了基础 。 关键词 :P1 ;二级结构 ;B 细胞表位 ;生物信息学 ;预测 ( ) 中图分类号 :S852 . 4 　　文献标识码 :A 　　文章编号 :1000 - 7091 2009 05 - 0045 - 05 Prediction of Secondary Structure and B Cell Epitope for VP2 Protein of Porcine Circoviruslike Agent P1 1 1 2 3 WEN Libin ,HE Kongwang ,YAN G Hanchun ,WAN G Yuran (1. Institute of Veterinary Medicine ,Jiangsu Academy of Agricultural Sciences ,Key Laboratory of Animal Diseases Diagnostic and Immunology ,Ministry of Agriculture National ,Center for Engineering Research of Veterinary Bioproducts ,Nanj ing 　210014 ,China ;2. Key Laboratory of Preventive Veterinary Medicine of the Ministry of Agriculture ,College of Veterinary Medicine ,China Agricultural University ,Beij ing 　100094 ,China ; 3.Animal Health Supervision Institute of Hebei Province ,Shij iazhuang 　0500