大豆疫霉PsMPK1沉默突变体的基因表达谱分析课件.PDFVIP

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-   南京农业大学学报  2016ꎬ39(3):386 393 http:/ / nauxb.njau.edu.cn   Journal of NanjingAgricultural University DOI:10.7685/ jnau.201509026 - 叶文武ꎬ张萌ꎬ曹明娜ꎬ等. 大豆疫霉PsMPK1沉默突变体的基因表达谱分析[J]. 南京农业大学学报ꎬ2016ꎬ39(3):386 393. 大豆疫霉PsMPK1沉默突变体的基因表达谱分析 叶文武ꎬ张萌ꎬ曹明娜ꎬ翟春花ꎬ李爱宁ꎬ王源超∗ (南京农业大学植物保护学院ꎬ江苏 南京 210095) 摘要:[目的]促有丝分裂原蛋白激酶(MAPK)是真核生物细胞信号转导途径中的关键蛋白激酶ꎬ对植物病原菌的生长发育 与侵染致病具有重要作用ꎮ 我们前期发现1个MAPK基因PsMPK1参与调控大豆疫霉的细胞壁完整性、菌丝生长、游动孢 子形成ꎬ以及对大豆的致病性等生物学性状ꎮ 本文旨在进一步探究PsMPK1如何调控大豆疫霉的上述性状ꎮ [方法]利用 数字基因表达谱技术对大豆疫霉PsMPK1沉默突变体在游动孢子囊阶段的基因表达情况进行分析ꎮ [结果]样品间基因表 达水平的整体相关性分析和实时定量PCR结果表明:数据具有较高的可靠性ꎮ 与野生型菌株相比ꎬPsMPK1沉默突变体中 分别有 1451个显著下调和981个显著上调的基因ꎬ占所有被检测基因的23%ꎮ 与之相比ꎬ被检测的细胞壁相关基因和分 泌蛋白编码基因中ꎬ显著差异表达的基因比例更高(分别占37%和28%)ꎬ且大部分基因为下调表达(分别占87%和78%)ꎮ 显著下调表达的分泌蛋白编码基因中ꎬ37个基因可能与侵染过程相关ꎬ主要编码 RxLR、NLP 和CRN等家族的效应分子ꎬ CBEL蛋白ꎬ富含半胱氨酸蛋白ꎬ氧化还原相关蛋白以及水解酶等ꎮ [结论]首次通过转录组学方法揭示了特定的功能基因 PsMPK1沉默后大豆疫霉基因组的转录变化ꎬ鉴定了可能与PsMPK1信号途径相关的基因和基因家族ꎬ为进一步研究大豆 疫霉中MAPK的调控网络奠定了基础ꎮ 关键词:大豆疫霉ꎻ促有丝分裂原蛋白激酶ꎻ细胞壁ꎻ致病性ꎻ效应分子ꎻ转录 - - - 中图分类号:Q945.8        文献标志码:A        文章编号:1000 2030(2016)03 0386 08 Gene expression profiling of aPsMPK1 ̄silenced mutant of Phytophthora sojae YE WenwuꎬZHANG MengꎬCAO MingnaꎬZHAI ChunhuaꎬLI AiningꎬWANG Yuanchao∗ (College of Plant ProtectionꎬNanjing Agricultural UniversityꎬNanjing 210095ꎬChina) Abstract:[Objectives]Mitogen ̄activated proteinkinase(MAPK)isaclassof importantproteinkinasesinsignaltransductionpathways of eukaryotic cellsꎬand involv

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