小麦taf1位点的连锁不平衡分析.pdfVIP

第8卷第1期 淮阴师范学院学报(自然科学版) V01．8No．1 2009年3月 OFHUAIYINTEACHERS Mar．2009 JOURNAL COLLEGE(NATURALSCIENCEEDITION) 小麦tafl位点的连锁不平衡分析 朱晓滨1’2，窦秉德1’2，侯北伟1’2， 徐海风1’2”，杨晋彬2，刘福霞2，顾正中3 (1．新疆农业大学农学院，新疆乌鲁木齐830052；2．淮阴师范学院江苏省环洪泽湖生态农业生物技术 重点实验室，江苏淮安223300；3．淮安市农业科学研究院，江苏淮安223001) 个普通小麦品种(系)组成的三个品种(系)群体进行群体结构的评估，发现在三个群体中都存 在群体结构．对消除群体结构后的三个亚群体中各标记的连锁不平衡值(1inkagedisequilibrium value)进行比较．结果表明，群体大小影响标记与雌性育性位点间的LD值．基于对小麦雌性育 获得这些较大LD值的标记(Xgwm71、Xwmc25等)，为研位点的精细定位做出了充分的准备． 关键词：小麦；钔位点；SSR；连锁不平衡；群体结构 中图分类号：S512．1文献标识码：A 文章编号：1671．6876(2009)01—0072．06 O 引言 小麦是世界上重要的粮食作物之一．小麦穗粒数是产量的构成因子…，而育性又是粒穗数形成的重 要基础．刘秉华等(1996)报道一种小麦雌雄性同时不育的现象拉j．小麦雄性育性已有较多的研究【3。．小 麦的雌性育性亦与产量相关．明确小麦雌性育性性状的遗传规律对小麦品种的改良具有重要意义．小麦 雌性不育系对于性别分化研究具有重要的理论意义，对于小麦杂种优势利用具可能有潜在的实践意 变体[7]，未见其育性可转换的报道，故不能解决不育材料的自身繁殖问题．窦秉德等(2001)报道了秋播 ，。育性正常，疋分离群体的育性分布呈连续双峰曲线．分析表明小麦雌性育性受两对主效基因加微 效多基因联合控制归J． 栽培作物在进化过程中除经历了自然选择以外，更是经历了人-E,tl化选择和育种选择两大瓶颈，在 此情况下，由于牵连效应的影响使得某些基因的两侧遗传多样性明显降低，对其发现QTL造成了很大 的困难[Ioj．关联作图(association disequilibriummapping)或关联分 mapping)，又称连锁不平衡作图(1inkage 析(association analysis)，曾广泛应用于人类遗传学研究中¨1|．该方法以自然群体为研究对象，以长期重组 后保留下来的基因(位点)间连锁不平衡(LD)为基础，将目标性状表型的多样性与基因(或标记位点)的 多态性结合分析，可直接鉴定出与表型变异密切相关且具有特定功能的基因位点或标记位点【l2J．所以， 对作图群体LD状况的了解程度直接关系到关联分析结果的准确性与精确性u3‘．而寻找具有较大LD值 是实现精确定位的重要步骤．由于群体结构的存在会通过影响位点LD而影响关联分析的准确性[14‘，造 成假阳性结果，所以削除群体结构，获得准确的LD值，是精确定位的又一重要因素． 收稿日期：2009-02-02 基金项目：国家自然科学基金资助项目 作者简介：朱晓滨(19s0-)，男，吉林人，硕士研究生，研究方向为小麦分子遗传 第1期 朱晓滨等：小麦坞n位点的连锁不平衡分析 73 本文利用全基因组SSR分子标记技术，在群体结构评估的前提下，比较了小、中、大三个群体中各 个标记的LD值．利用蜘位点连锁分析的信息H引，对其所在的染色体2DS上分子标记的∞值进行了 研究，检测出更多、LD值较大的SSR标记可用于加密2DS连锁群，不但为关联分析做了充分的准备．而 且可能蕴含了第二个主效位点的位置信息． 1材料与方法 1．1供试材料 (系)的“自然”群体为研究对象．其中，小群体由小麦雌性不育系XNDl26和120个小麦品种(系)组成， 260个小麦品种(系)组成． 1．2供试标记 列【