应用SSR和SRAP标记构建青虾遗传连锁图谱.pdfVIP

中国水产科学2012年3月，19(2)：202—210 Joumalof SciencesofChina Fishery 研究论文 DoI：lO．3724／SP．J．1118．2012．00202 应用SSR和SRAP标记构建青虾遗传连锁图谱 乔慧1，一，吴滟2，傅洪拓1，一，龚永生2，蒋速飞2，熊贻伟2 1．南京农业大学渔业学院，江苏无锡214081； 2．中国水产科学研究院淡水渔业研究中心，淡水渔业和种质资源利用重点实验室， 江苏无锡214081 锁群有35个，连锁对18个，平均每个连锁群的标记数为3．3个；连锁群长度在6．7—91．2cM之间，相邻标记间最大 间隔为49．o 270．5 cM，最小为1．4cM，平均间隔为13．1cM。青虾框架图谱长度为997．2cM，图谱观察总长度为2 380．6 cM，根据估算，青虾遗传连锁图谱预期长度为4 cM，图谱的覆盖率为51．83％。本研究构建了青虾遗传连锁 图谱，该图谱也是淡水虾蟹类第一张遗传连锁图谱，可为青虾QTL定位、基因克隆、遗传选育等提供指导，并为 进一步构建高密度的青虾遗传连锁图谱奠定了基础。 关键词：青虾；日本沼虾；ssR；SRAP；遗传连锁图谱 中图分类号：S96 文献标志码：A 文章编号：1005—8737一(2012)01—0202—09 遗传连锁图谱构建是遗传学研究的一个重要 领域，它为进一步认识基因组组成、克隆染色体 沼虾，是中国重要的淡水养殖虾种类，随着累代 的基因及定位重要经济性状的主效基因奠定了基 养殖规模的扩大，养殖过程中普遍出现品种退化 assisted 础，也是实现分子标记辅助育种(marker 现象，因此必须加强青虾的遗传改良与良种选 selection，MAs)的重要手段。目前，已有多种重要育。有关青虾群体遗传多样性分析及性状相关分 经济鱼类和贝类构建了遗传连锁图谱，包括鲤 子标记初步筛选等已有报道[12_151，但其遗传连锁 图谱构建迄今未见报道。本研究采用微卫星标记 (C功一聍淞c口印iD)、虹鳟(D”cD哟，c办驸，砂尼i舳)、 (simplesequence 罗非鱼(G忱Dc办加聊括spp．)、太平洋牡蛎(C砌，，伽胞口 态性标记(sequence．relatedamplifiedpolymo卜 酌g嬲)、贻贝(岣删协P幽凰)等[1_6|，其中虹鳟【2]、罗 非鱼[3】等已构建第二代图谱，可满足进一步QTL 精细定位的需要。虾蟹类方面，已报道了中国对 锁图谱，旨在为青虾高密度遗传连锁图谱的构建奠 定基础，并为分子标记辅助育种工作提供参考。 虾旧P刀口ewc办f行e刀J妇)‘川、日本对虾俨e胛口P淞，口一 印玎fc姗)吲、凡纳滨对虾沪P胛口P伽，f幻pP刀口P淞 1材料与方法 阳胛聊册fc炉]、斑节对虾俾P胛口e淞m伽D如“10】和三 1．1作图群体 疣梭子蟹俨D，Jf甜以螂护ff柏P陀甜肠f甜s)[11]等的遗传连 锁图谱，但密度均较低，而淡水虾蟹类遗传图谱 试验用青虾的亲本均来自野生种群，捕获后 构建还未见报道。 经单独驯养用于实验，其中父本采自珠江河口段， 收稿日期：20ll一08一08：修订日期：2011—10—26． 作者简介：乔慧(1981一)，女，博士，主要从事水产动物遗传育种研究．E_mail：qhl212000@126．com 通信作者：傅洪拓，研究员，博士生导师．E．