lncrna及其生物学功能lncrna and its biological function.pdf

Online system: 农 业 生 物 技 术 学 报 Journal of Agricultural Biotechnology 2016, 24(4): 600~612 DOI: 10.3969/j.issn. 1674-7968.2016.04.015 lncRNA 及其生物学功能 李睿 罗云波* 中国农业大学食品科学与营养工程学院，北京100083 *通讯作者，lyb@ 摘 要 长链非编码RNA (long non-coding RNA, lncRNA)是一类长度＞200 nt 、生物来源广泛、二级及三 级结构高度保守的RNA 分子。lncRNA 生物学功能丰富，广泛参与生物体各类重要生理过程，在转录、转 录后表观遗传水平上对靶基因的表达进行调控，其精细的分子调控机制已在染色体剂量补偿、基因组印 记、靶目标模仿、功能性蛋白质转运等生物学过程中被广泛揭示。随着lncRNA 生物学作用机制不断被揭 示，研究者发现，高度保守的lncRNA 二级、三级结构对其生物学功能的发挥至关重要。目前研究者主要 采用计算机手段和数学方法对lncRNA 高级功能结构域进行预测，从结构上阐明其生物学调控机制。关 于lncRNA 相关研究方法也在近年来得到了飞速的发展，比较成熟的技术例如RNA 纯化的染色质分离 (chromatin isolation by RNA purification, ChIRP) 和 RNA 结合蛋白免疫沉淀(RNA- binding protein immunoprecipitation, RIP) 已逐渐成为该领域内研究lncRNA 与染色质、lncRNA 与蛋白质之间相互作用的 热门技术。本文主要就lncRNA 来源、分类标准、生物学功能、高级结构预测及相关研究方法进行了综述， 旨在为更好地理解和研究lncRNA 在生物体内的作用提供参考。 关键词 长链非编码RNA(lncRNA) ，生物学功能，分子调控机制，功能域预测，研究方法 中图分类号 Q71 文献标识码 A lncRNA and Its Biological Function LI Rui LUO Yun-Bo* College of Food Science and Nutritional Engineering, China Agricultural University, Beijing100083, China * Corresponding author, lyb@ Abstract Long non- coding RNA (lncRNA) is a group of RNAs with broad biogenesis, which are longer than 200 nt and highly conserved in their secondary and tertiary structures. lncRNA that broadly participates in varied physiological processes in organisms has abundant biological function and can regulate expression of target genes at transcriptional, post- transcriptional and epigenetic levels. Furthermore, its sophisticated molecular regulatory mechanisms have already been widely revealed in biological processes such as chromosome dosage compensation, genomic imprinting, target mimicry, functional protein trafficking, and so on. As with the biological function of lncRNA being continuously revealed