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第七章基因组学与基因预测
第七章 基因组学与基因预测
20世纪人类科技发展史上的三大创举
90 年代
60 年代人类首次登上月球
40 年代第一颗原子弹爆炸
鸟枪法基因组测序
7.1基因组学
研究与解读生物基因组所蕴藏的生
物全部性状的所有遗传信息的科学
•结构基因组学
•功能基因组学
•比较基因组学
基因组学包括3个不同的亚领域
结构基因组学(structural genomics)
功能基因组学(functional genomics)
比较基因组学(comparative genomics)
基因组学概念
*结构基因组学
•结构基因组学(structural genomics) 是通过
HGP 的实施来完成的。
•HGP 的内容就是制作高分辨率的人类遗传图
和物理图,最终完成人类和其它重要模式生物
全部基因组DNA 序列测定,因此HGP属于结
构基因组学范畴。
*功能基因组学
•完成一个生物体全部基因组测序后即进入
后基因组测序阶段——详尽分析序列,描
述基因组所有基因的功能,包括研究基因
的表达及其调控模式,这就是功能基因组
学(functional genomics)。
主要具体内容包括以下方面
(一)鉴定DNA序列中的基因
(二)同源有哪些信誉好的足球投注网站设计基因功能
(三)实验性设计基因功能
(四)描述基因表达模式
功能基因组学研究策略及主要内容
功能基因组学研究
1. 概念:利用结构基因组学提供的信息
,以高通量,大规模实验方法及统计与
计算机分析为特征,全面系统地分析全
部基因的功能。
2. 基因功能的研究方法
(1) 基因转导技术:导入细胞,观
察功能。该方法用的最多,技术最
成熟。
比较基因组学(Comparative Genomics)
是基于基因组图谱和测序基础上,对
已知的基因和基因组结构进行比较,
来了解基因的功能、表达机理和物种
进化的学科。
基本完成DNA序列分析的真核生物基因组比较
物种 完成 总长度 已完成总长 占常染色质 基因数
年份 /Mp 的百分数/% 百分数/Mb /Mb
酵母 1996 12 93 100 483
线虫 1998 96 99 100 197
果蝇 2000 116 64 97 117
拟南芥 2000 115 92 100 221
人类第21染色体 2000 34 75 100 7
人类第22染色体 1999 34 70 97 16
人类全基因组 2001 2693 84 90 12
(Public Sequence)
人类全基因组 2001 2654 83 99-93 15
(Celera Sequence)
7.2基因预测
基因预测:早期指预测DNA序列中编码蛋
白质的部分,即外显子部分;现在指整个
基因结构的预测,综合各种外显子预测
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