关于虎纹阵痛肽-1的讨论 - 北大生物信息中心.pdf

关于虎纹阵痛肽-I 的讨论 车南颖 第一组:abc04a05 一.对蜘蛛毒素及其中一种毒素 (虎纹阵痛肽)的简介 蛛是古老的动物,最早的化石记录显示在 3 亿年前的石炭纪 蛛就已经存 在于地球了.相对于 蛛的漫长的进化时间而言, 蛛形态上的分化不是非常显 著.这可能与它们很早就有毒液有关.毒液的主要作用是麻痹和杀死猎物,遇到其 他肉食性动物时的防御作用,以及可能的预消化作用.蜘蛛毒素成分复杂,组成上 来看,粗毒主要成分是蛋白质和多肽类神经毒素,还含有多胺类神经毒素、多种酶 类、激肽类似物、溶血物质、凝聚素、抗菌肽、氨基酸、ATP、核苷酸、单胺类等活性物 质. 虎纹阵痛肽-I(HWTX-I)是从中国稀有的蜘蛛物种虎纹捕鸟蛛(Selenocosmia huwena Wang)中分离纯化出来的神经毒素,是突触前膜N 型钙离子通道的阻断剂. HWTX-I 由 33 个氨基酸组成,含有三对二硫键,现 已确定是 以 I-IV,II- V,III-VI 的方式配对,三对二硫键配合三股反平行的 β折叠形成一个非常致密 稳定的结构.采用核磁共振二维氢谱的方法解析出来的HWTX-1 的空间结构是典 型的抑制剂胱氨酸结结构模体(Inhibitor Cystine Knot motif, ICK模体). 蛛毒素 cDNA 结构 :5′非翻译区域 + 富含疏水性氨基酸的信号肽区域 (pre区)(与 蛛毒素分泌特性有关) + 富含 Glu 等酸性氨基酸的信号肽与成熟 蛋白之间的间隔区域 (pro区) + 成熟蛋白区域 + 间隔区(pro区) + 3′非翻译 区域. 5′UTR pre 区 pro 区 mature pro 区 3′UTR peptide HWTX-I 前体蛋白由 81个氨基酸组成,而经过剪切后的成熟蛋白只有 33 个氨基 酸组成. 二.HWTX-I 的PROT IN-PROT IN BLAST 结果 一.用 HWTX-I 的mature chain 做 protein-protein Blast 结果(CBI TOOL): Query= hwtx-1 (33 letters) Distribution of 12 Blast Hits on the Query Sequence Scor e E Sequences producing significant alignments: (bits) Value pir ||A37479 huwentoxin-I - Chinese bird spider gi |451267|g... 85 3e-16 sp|P56676|TXH1_SELHU Huwentoxin-I precursor (HwTx-I) gi |30... 85 3e-16 pdb |1QK6|A Chain A, Solution Structure Of Huwentoxin-I By Nmr 84 8e-16 gb |AAF25774.1 |AF157504_1 huwentoxin-I [Selenocosmia huwena] 84 8e-16 sp|P83464 |TXN3_SELHA Hainantoxin-III (HnTx-III) 63 1e-09 sp|P83591 |TXN1_SELHA Hainantoxin-I (HnTx-I) 47 8e-05 pdb |1NIX|A Chain A, Three Dimensional Solution Struc