全交互智能化化学课件及实现方法浅析.pdfVIP

2006年，第9期 计算机在化学中的应用 47 Atom：C2 Group：MOL1(一般出现在小分子文 件中) 4062 89Chaj-n：D 或者Atom：CAGroup：SER (一般出现在蛋白质分子文件中) 根据以上信息即可了解所选原子或整个分子的 结构信息和相互的从属关系。 ClickAction、 若依次进行Select、Mouse 图2不同显示模式下的血红蛋白分子 Distance操作，任意点击两个原子，即可得到这两 CMme插件是一种能够高效显示和渲染分子结 个原子之间的距离；当点击的为相互紧临的原子， 构及其相关信息的网络插件，其支持脚本代码的编 所求距离即为键长。选择An班e操作并且任意点击三 程来实现复杂的交互效果，在国外化学网络教学中 个原子，即可求得它们所成的角度；当原子相互紧 得到很大程度的重视。该插件不仅适用于网络教 临，所求角度即为键角。 学，同时也适用于课堂教学和学生自学时使用，还 5显示蛋白质、核苷大分子 可建立化学结构数据库，有助于实现微观化学结构 能显示蛋白质结构的主要是PDB格式文件。蛋 的可视化和交互，加深学生对所学科学知识的理 白质结构的模拟显示与一般小分子结构的模拟显示 解。 并没有太大的区别。研究表明，多肽链能聚集结合 形成复杂的三级结构，多个亚基自我装配为四级结 构。为了有效呈现蛋白质的多肽链，在C硒[ne插件 悱朋 晾 一 中，蛋白质、核苷高分子另有多种独特的表征模 式。即前文提及的Bauckbone模式(呈链节状)(图2一 A)、Ribbons模式(呈丝带状)、Stmds模式(呈细绳 ～～～～ ㈨㈨№№ 一～一～ ～．一一一 状)和Cartonons模式(里块节状)(图2一B)。 关于蛋白质分子颜色的显示，前文已有一定论 ～～‰胁 眦珊 一～ 述。综合利用前文所介绍的各种方法，可加深对蛋 白质大分子的了解。另外，使用Select和Chain选 ：～～～～一～～～～眦～ 糠㈣淼苗咒柑 吼 项，可单独选择一条肽链，接着改变其颜色显示方 ．～一～～～～～～～一～一 一堇；一～一一～～一．一 一一 式，能得到不同的呈现效果。 全交互智能化化学课件及实现方法浅析 任建华，冉呜 (四川师范大学化学与材料科学学院，成都，610066) 摘要：利用naush作为平台进行了尝试，开发制作了操作过程全交互，智能化的化学新型课件，对其概念和具体 实现方法进行了探讨。 关键词：化学课件；全交互；智能化；探究性； nash 文章编号：1005—6629(2006)09—0047一03中图分类号：G633．67文献标识码：B