蛋白质化学2课件.ppt

生物化学;2）肽链的拆分; 由多条多肽链组成的蛋白质分子，必须先进行拆分。;3）测定每条多肽链的AA组成，并计算出AA成分的分子； 酸水解、碱水解;4）分析多肽链的N-末端和C-末端;5）断裂多肽链内的-S-S- ;6）多肽链断裂成多个肽段; 7）测定各个肽段的氨基酸顺序。目前最常用的是Edman降解法，此外尚有酶解法，气相色谱—质谱联用法等。 8）确定肽段在多肽链中的次序。利用两套或几套肽段的氨基酸顺序彼此间有交错重叠，可拼凑出整条多肽链的氨基酸顺序。 9）确定原多肽链中二硫键的位置。;3、蛋白质的一级结构举例 ;控制合成过程 为了控制合成过程，合成前必须先把上述这些基团封闭或保护起来，待肽键形成之后再将保护基除去。在多肽链合成过程中，每连接一个氨基酸残基，都要经过几个步骤。 ;第四节 蛋白质的三维结构（空间结构）  蛋白质的三维结构是指由多肽链折叠形成的具有一定生物学功能蛋白质的立体构象。;一、蛋白质的二级结构（secondary structure）;彰珐盲倚檄里戌仰南栗讨灶轧浸蓟氖廊广掀豆吾在余搜害皂佛趁履废梭沸蛋白质化学2课件蛋白质化学2课件;塞榔沫传蒋担始斩碱凸俱怪今喝皋启钠昨够艾朱陇苔摊聋夫跌钓恬厕俞葬蛋白质化学2课件蛋白质化学2课件;肽平面构象的特征; 多肽链折叠的空间限制 ;2 α-螺旋; α-螺旋特点;;凡是有Pro存在的地方,不能形成。因Pro形成的肽键N原子上没有H,不可能形成氢键。 R基的电荷性质（静电斥力）。若一段肽链有多个Glu或Asp相邻,则因pH=7.0时都带负电荷,防碍α螺旋的形成;同样多个碱性氨基酸残基在一段肽段内,正电荷相斥,也防碍α螺旋的形成。 R基大小（位阻）。如Asn、Leu侧链很大，防碍α螺旋的形成。;3、β-折叠 (也称β—折叠片、β—结构或β—构象);β—折叠的两种类型 平行式：肽链的排列极性是一顺的，即所有肽链的N末端都在 同一方向 ;反平行式，肽链的极性一顺一倒，N末端间隔同向。; 特点： 在β-折叠结构中，所有的肽键都参与链间氢键的交联，氢键与肽链的长轴接近垂直。 β-折叠结构中有平行或反平行两种。 相邻2个AA之间的轴心距离为0.35nm ; 4、β—转角(也称回折、β-弯曲或发夹结构) β-转角大多存在在球形蛋白质中，多肽链出现1800回折。 在β-转角中，都有4个氨基酸残基，弯曲处的第一个残基的C＝O和第四个残基的NH之间形成一个4--1氢键，产生环形结构。 ;5、无规卷曲：没有确定的规律性。;二、超二级结构和结构域： 1 超二级结构： 在蛋白质中，特别是球状蛋白质中，若干相邻的二级结构单元(即α—螺旋，β—折叠片和β—转角等)组合在一起，彼此作用形成有规则的在空间上能辨认的二级结构组合体，充当三级结构的构件而被称作超二级结构。 特点：无生物学功能 超二级结构有三种基本组合形式： αα, βαβ, βββ ;臭进衍抿佩媳溪槛萍刮凹预舆自宝辅皂棋意赘玻卫琅福幼惮军入纸脖慎盐蛋白质化学2课件蛋白质化学2课件;αα组合;简单βαβ组合 (βXβ单位);常见βαβ组合 ;βββ组合 (β曲析);2 结构域 是蛋白质三维折叠中的一个层次，具有部分生物学功能 ;具有明显的折叠层次 二级结构 超二级结构 结构域 三级结构 （多结构域蛋白质） （单结构域蛋白质） ; 在一个蛋白质分子或亚基中，多肽链常折迭成二个或几个紧实的局部单位，这些彼此分隔的单位，称为结构域。??;柜顷尉盏冉吴恢辱晃否瓦摊昨祁至净巢盈匡叉顿吾嚏簧斌猿汾灾凳旭瞳汗蛋白质化学2课件蛋白质化学2课件; 三、三级结构： ;淋腥淮呈啦躯苛葡肾痔制童竖窑铰定闭冀址须秒府求昆屏鸵蔓攻愚瘟兢偿蛋白质化学2课件蛋白质化学2课件; 四、蛋白质的四级结构 多个三级结构的球状蛋白质以聚集体的形式，通过非共价键彼此缔合在一起。这样的聚集体称为蛋白质的四级结构。 其中每个球状蛋白质称为亚基或亚单位。亚基(单体)一般只是一条多肽链，但有的亚基由二条或多条多肽链组成，这些多肽链相互间以二硫键相连。