基因芯片技术在生物研究中的应用进展-江苏农业科学.PDF

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基因芯片技术在生物研究中的应用进展-江苏农业科学

— 60— 江苏农业科学 2014年第42卷第5期 邱秀文,吴小芹,黄 麟,等.基因芯片技术在生物研究中的应用进展[J].江苏农业科学,2014,42(5):60-62. 基因芯片技术在生物研究中的应用进展 邱秀文,吴小芹,黄 麟,叶建仁 (南京林业大学森林资源与环境学院/江苏省有害生物入侵预防与控制重点实验室,江苏南京210037)   摘要:基因芯片是生物科学领域的一项高新技术,在基因组测序、基因表达、发现新基因、基因芯片绘制图谱及病 原检测等方面得到了广泛应用。本研究介绍了基因芯片技术在生物研究中的研究进展,并对未来研究方向进行展望。   关键词:基因芯片;DNA微阵列;DNA测序   中图分类号:Q789  文献标志码:A  文章编号:1002-1302(2014)05-0060-03   基因芯片技术是将大量已知序列的核酸片段有规律地固 基因芯片的制备方法有2种:一种是原位合成法,是指将 定在玻璃片、硅片、尼龙膜等各种固体支持物上形成分子阵 数量众多的电极固定在固相支持物上,电极上具有生物亲和 列,然后与用荧光标记过的核酸样品进行杂交,当样品与基因 性的多孔空间,用于合成DNA片段所需的4种单核苷酸可以 芯片上对应位置的核酸探针发生互补配对时,可以通过荧光 进入电极上的多孔空间,在电极上合成DNA片段,原位合成 强度来确定探针位置,获得与探针互补的核酸序列,从而获知 法又可分为光导原位合成法与原位喷印合成法;另一种是直 样品信息。高通量是基因芯片的最大优点,在基因芯片出现 接点样法,是指将人工合成的寡核苷酸片段直接点在固相支 之前,研究基因表达变化的手段包括原位杂交技术、Northern 持物上。原位合成法一般用于制备基因芯片,直接点样法既 [5] Blot技术,这2种技术的缺点是低通量,很难在有限的试验次 可以用于制备基因芯片也可以用于制备蛋白质芯片 。 数内检测众多基因的变化规律。由于基因芯片技术自动化程 1.2.1 光导原位合成法 光导原位合成法是由美国昂飞公 度高、效率也高,因此,在研究基因组测序、基因表达、发现新 司研发的,利用光敏保护基将碱基单体的5′端羟基保护起 基因、基因芯片绘制图谱及病原检测等方面都得到了广泛的 来,之后固相支持物上的光敏保护基与1个核苷酸单体连接, 运用。本研究介绍基因芯片技术在生物研究中的研究进展, 如此循环直到合成完成。光导原位合成法制备探针之间的距 2 旨在为推广基因芯片技术提供依据。 离为5~10 m,1cm 可以容纳106个探针,这种方法的优点 μ 是步骤简单、合成速度快且合成探针量大,缺点是合成的探针 1 基因芯片概述 [6-9] 长度不是很长 。 基因芯片(genechip)别称DNA芯片、DNA微阵列、寡核 1.2.2 原位喷印合成法 喷印合成法原理与传统的DNA固 [1] 苷酸微阵列,是生物芯片的一种 。基因芯片技术最早出现 相合成原理一致,形式类似于喷墨打印,有多个喷印头及墨 [2] 在美国,具有快速、高效、连续、准确等特点 。该技术是以 盒,墨盒里面装有4种碱基的液体。喷印头可以在整个载体 基因探针、核酸杂交技术为基础的核酸序列分析方法[3]。基

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