杯果木CCR基因克隆和同源进化分析-中国桉树.PDF

第 26 卷 第 1 期 桉 树 科 技 Vol . 26 No . 1 2009 年 6 月 EUCAL YPT SCIENCE TECHNOLOGY J un. 2009 杯果木 CCR 基因克隆和同源进化分析 陈碧华 (福建省林业科学研究院 , 福建 福州 350012) 摘要 :从粗毛杯果木和软叶杯果木基因组中克隆 CCR 基因 ,经测序验证扩增片断长度均为 232 1 bp ,包含部分外显子 3 、4 和部分 5 , 以及内含子 3 和 4 。同源性比较分析表明: 粗毛杯果木与伞房属树种 CCR 的同源相似性达到 98 %～ 87 % , 与桉属树种 CCR 的同源相似性达到 97 %～84 % ; 而软叶杯果木与伞房属树种 CCR 的同源相似性达到 98 %～ 87 % ,与桉属树种 CCR 的同源相似性达到 95 %～84 % 。总体上 ,该 2 个杯果木树种与伞房属 CCR 同源相似性较高 , 而与桉属 CCR 同源相似性较低 。3 个属中最长保守序列位于 Exon 5 的第 3147～3175 位点 ,共 29 个碱基 。保守区域 主要集中于 Exon 5 ,少数于 Intron 4 。桉属总变异率大于杯果木属和伞房属 。桉属 Exon 4 变异率大于属内其它 Exon 或 Intron ; 同样发现 Exon 4 的简约信息位点百分数大于属内其它 Exon 或 Intron , 但杯果木属中的 Intron 3 变异率高于属 内其它 Exon 或 Intron 。伞房属以 Exon 5 的变异率最高 。Exon 或 Intron 平均变异率均以桉属最多 ,其次是杯果木属 ,最 少的是伞房属 。使用 MEGA3. 1 软件构建的 CCR 进化树表明 ,桉属 、伞房属和杯果木属分别形成单系 ,其亲缘关系可 以明显区分开来 。杯果木属最早产生分歧 ,并形成单独一个分枝 ;其次是伞房属 ,也形成单独一个分枝 ,进化较杯果 木属迟 ;最迟进化的是桉属 ,也形成单独一个分枝 。这种结果与形态学比较接近 ,易为人们所接受 。 关键词 :粗毛杯果木 ;软叶杯果木 ; CCR 基因;基因克隆; 同源性 ;分子进化 中图分类号 :S792. 39 文献标识码 :A Clonin and Ph lo enetic Anal sis of CCR Gene of Angophor a s . g y g y pp CHEN Bi - hua ( Fu ian Academ o Fores tr , Fuzhou 350012 , Fu ian , China) j y f y j Abstract : The CCR enes of An o hora his ida and An o hora s ubvelutina were cloned for se uenc g g p p g p q in . The se uence len