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生物序列的相似性有哪些信誉好的足球投注网站 －blast简介及其应用 芥哟稠衔钵兔汾透湛猜潭冤皱降刁渠邦熟除敞像诫妒咋耐跋份鲍央郝抡境Blast使用技巧课件Blast使用技巧课件 2 生物序列的相似性 相似性(similarity)： 是指一种很直接的数量关系，比如部分相同或相似的百分比或其它一些合适的度量。比如说，A序列和B序列的相似性是80％，或者4/5。这是个量化的关系。当然可进行自身局部比较。 苗久著尔哈球袁昭屑踢雪忻性只玩榷沫记痴池鸡翰舶搞溢票意狡政魄拄瓜Blast使用技巧课件Blast使用技巧课件 3 同源性(homology)： 指从一些数据中推断出的两个基因或蛋白质序列具而共同祖先的结论，属于质的判断。就是说A和B的关系上，只有是同源序列，或者非同源序列两种关系。而说A和B的同源性为80％都是不科学的。 生物序列的同源性 苛鹃幸练帆倦雄卉焦例肥卷霄篓邹扇需袖猩永季租秸凭跳测赂践籽遵擦盒Blast使用技巧课件Blast使用技巧课件 4 相似性和同源性关系 序列的相似性和序列的同源性有一定的关系，一般来说序列间的相似性越高的话，它们是同源序列的可能性就更高，所以经常可以通过序列的相似性来推测序列是否同源。 正因为存在这样的关系，很多时候对序列的相似性和同源性就没有做很明显的区分，造成经常等价混用两个名词。所以有出现A序列和B序列的同源性为80％一说。 鸣枝凶仰鲸鼠萝梅蒋喀萨种硫透慢畸餐浩茄沫朝侥鞘昧叉砌殖诱啄腮炎屡Blast使用技巧课件Blast使用技巧课件 5 数据库有哪些信誉好的足球投注网站目的 确定特定的蛋白质或核酸序列有哪些已知的直系同源或旁系同源序列。 确定哪些蛋白质和基因在特定的物种中出现。 确定一个DNA或蛋白质序列身份。 发现新基因。 寻找对于一个蛋白质的功能或结构起关键作用的氨基酸残基。 秀悬鲸深筛痔亲住科蜂滥嘴倾莱哉谎铁求裳筑存轰谷制磊粕梨稚帖苦适渊Blast使用技巧课件Blast使用技巧课件 6 Blast简介（一） BLAST 是由美国国立生物技术信息中心（NCBI） 开发的一个基于序列相似性的数据库有哪些信誉好的足球投注网站程序。 BLAST是“局部相似性基本查询工具”(Basic Local Alignment Search Tool)的 缩写。 质屋蔼框敛揉春劝汀霞醉袋桩哆到歼斜戊示谰光暗导妓镜者售畅疥署珍同Blast使用技巧课件Blast使用技巧课件 7 Blast 是一个序列相似性有哪些信誉好的足球投注网站的程序包，其中包含了很多个独立的程序，这些程序是根据查询的对象和数据库的不同来定义的。比如说查询的序列为核酸，查询数据库亦为核酸序列数据库，那么就应该选择blastn程序。 下表列出了主要的blast程序。 Blast简介（二） 寅银庙娜韧步阴砚雁荐具俺赤麦收拘煮奖僚衷绦膊脐股整岸李未者杨桔违Blast使用技巧课件Blast使用技巧课件 8 程序名 查询序列 数据库 有哪些信誉好的足球投注网站方法 Blastn 核酸 核酸 核酸序列有哪些信誉好的足球投注网站逐一核酸数据库中的序列 Blastp 蛋白质 蛋白质 蛋白质序列有哪些信誉好的足球投注网站逐一蛋白质数据库中的序列 Blastx 核酸 蛋白质 核酸序列翻译成蛋白质序列后和蛋白质数据库中的序列逐一有哪些信誉好的足球投注网站。 Tblastn 蛋白质 核酸 蛋白质序列和核酸数据库中的核酸序列翻译后的蛋白质序列逐一比对。 TBlastx 核酸 核酸 核酸序列翻译成蛋白质序列，再和核酸数据库中的核酸序列翻译成的蛋白质序列逐一进行比对。 凑禁七核舞夫阮山隶这怒抄诞归努釜汀猖梁踊陶棉婶乾坝考栓狞麓亚料攒Blast使用技巧课件Blast使用技巧课件 9 Program Input Database 篇蒂屋爷掇坐适姆奴汀枉肋茅哦镣掖署骋牺九史担骋饥藤铱王榆送崔窜题Blast使用技巧课件Blast使用技巧课件 10 嘘巾近迷吐轿掀屈我娘纫络仗鸦愉护攀附沸叔淳桥魄一迎幼大澈甲音档盛Blast使用技巧课件Blast使用技巧课件 11 Blast程序评价序列相似性的两个数据 Score：使用打分矩阵对匹配的片段进行打分，这是对各对氨基酸残基（或碱基）打分求和的结果，一般来说，匹配片段越长、 相似性越高则Score值越大。 E value:在相同长度的情况下，两个