SSR技术及其应用.pdf

2001年6 月 热 带 农 业 科 学 第3 期( 总第91期) Jun.2001 CHINESE JOURN L OF TROPIC L GRICULTURE No.3 2001 ¹ SSR 技术及 其 应 用 曾莉娟 ( 0898- 2330 1984) 郑成木 ( 0898- 2330 0172) 综述了SSR( Simple SequenceRepeat, 简单重复序列)技术的基本原理, 及其在植物基 因定位和QTLs 分析、DN 指纹和 种鉴定、种质资源保存和利用、系谱分析和标记辅助育 种等方面的应用。 核苷酸重复序列; 微卫星; SSR; 基因定位 Q523.6; Q343. 17 分子标记能在DN 水平上反映植物 种由2~ 5 个核苷酸为重复单位串联组成的 [3] 遗传基础的差异,是植物遗传育种领域内的 长达几十个核苷酸的序列 。SSR 广泛分 [1] 一项新兴技术 。SSR ( Simple Sequence 布于整个真核生物基因组的不同座位上, 由 Repeat, 简单重复序列) 就是当今四大分子 于在各个座位上重复单位的数量可能不完 标记技术之一。1989 年, 3 个独立的研究 全相同, 因而形成多态性, 即 SSR 分子标 [4] 小组几乎同时建立了这一技术,并且证实它 记 。微卫星位点的重复单位拷贝数, 可 作为位点特异遗传标记具有巨大潜力。 能由于有丝分裂过程中同源微卫星间的不 SSR 技术的特点是: 呈共显性遗传; 在数量 等交换或复制过程中DN 滑动而高度可 方面没有生物学上的限制; 其标记带型简 变, 因而显示出丰富的多态性。在重复序列 单,记录的条带一致、客观、明确; 采用PCR 的两端,往往是相对保守的限制性内切酶位 技术进行检测只需少量DN 样 ,且质量 点。所以,通过特异性引物进行PCR 扩增 要求不高, 即使是部分降解的样 也可进行 反应、琼脂糖凝胶电泳(或聚丙烯酰胺凝胶 分析;每个位点均有许多等位形式;另外,它 电泳)和放射自显影(或银染) ,就可以检测 还具有多态性高、实验程序简单等优点。当 到在简单重复序列重复单位数不同的DN 今世界上四大标记系统的综合效用大小比 区域的多态性。 [2] 较关系为: FLP SSR R PD RFLP 。 2 SSR 1 SSR 由于 SSR 具有按照孟德尔方式分离、 SSR也称微卫星(Microsatellite) , 是一 呈共显性遗传、在数量方面没有生物学上的 ¹ 收稿日期:2000- 11- 10 编辑/郑里程 ) 56 ) 曾莉娟 等 SSR 技术及其应用 限制、多态性高、实验程序简单等优点, 所以 串联排列( GT T ) 和简单重复序列 n 自1989 年SSR 技术产生以来, 被广泛应用 (G C ) , 而且显示出高度限