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活性小分子功能筛选平台M&Function的设计与实现.pdf
搪 ‘医 版
复 里亏 学 Sci 2…)【…12N…。 .,39…(6) 633
Fudan UU nniivv J M ed
活性小分子功能筛选平台M &Function
的设计与实现
陈 健 鞠元虎 修 婧 张国庆 南 蓬地
(复旦大学生命科学学院生物多样性与生态工程教育部重点实验室 上海 201)433
。上海生物信息技术研究 中心 上海 200235)
【摘要】 目的 建立一个综合了生物信息学和化学信息学的网络信息平台M Function,致力于新药筛选和
研究。方法 通过数据挖掘,整合小分子药物的名称、结构、功能、分类等信息,建立一个小分子药物信息资源
库 。在此基础上 ,借助基于最大公共子结构(maximumcommonsubstructure,MCS)和 Fingerprint的结构 比对软
件 ,通过统计分析 ,建立了功能预测系统,对活性小分子进行生物学功能预测 。结果 M Function平 台拥有
丰富的数据信息、内嵌的图形显示和数据统计插件人性化 的网站设计 ,具有直观 、高效、简便易用、测试数据结果
可靠等优点。结论 M 8LFunction平 台不仅是一个小分子药物信息资源库 ,也是一个小分子功能预测平 台,可
以为高通量先导化合物的筛选提供信息准备和数据支持。网站可以通过 http://lifecenter.sgst.cn/mcs/home.
do进 行访 问。
【关键词】 药物数据库 ; 新药筛选 ; 功能预测
【中图分类号】 R915 【文献标 志码】 A doi:i0.3969/j.issn.1672—8467.2012。06。017
Function screeningsystem ofactivesmallmolecule:
DesignofM & Functionplatform
CHEN Jian ,JU Yuan—hu ,XIU Jing’,ZHANG Guo—qing ,NAN Peng△
(MinistryoJEducationKeyLaboratoryforBiodiversityScienceandEcologicalEngineering,SchoolofLifeSciences,
FudanUniversity,Shanghai200433,China; ShanghaiCenterforBioinJormationTechnology,Shanghai200235,China)
[Abstract] Objective Todevelopacomprehensive,web—accessibledatabaseM Functioncombining
bioinformaticsandcheminformaties,which can dedicateto new drug research and development.
M ethods Through data mining,we integrate smallmolecule drug names,structures,functions,
classificationsand otherinformation.Then weestablish a smallmoleculedrug information resource
library.Basedonthemaximum commonsubstructure-based (MCS-based)andFingerprintalgorithms,
andstatisticalanalysis,weestablish thesystem forfunction predictionofactivesmallmolecules.
Results Becauseofitscompr
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