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孙涛李明哲崔淑华尹伟力摘要关键词引言基金项目通讯作者现有检疫技术的瓶颈动物检疫工作中病原样本检测的主要问题送检样本的基质及新发疫病日趋复杂化高通量测序在动物检疫样本分析上的应用现状应用高通量测序解析动物检疫样本的现状样本前处理流程的复杂化高通量测序数据的生物信息学分析在解析病原亚型上的应用在样本功能基因注释中的应用在解析样本群落进化特征上的应用总结与展望参考文献责任编辑姚菲作者简介孙涛高级兽医师主要研究方向为动物源性食品安全检测
8 5 Vol. 8 No. 5
2017 5 Journal of Food Safety and Quality May. , 2017
1* 1 1 2
孙 涛 , 李明哲 , 崔淑华 , 尹伟力
(1. , 266002; 2. , 264000)
摘 要: ,
,
,
, ,
,
,
关键词: ; ;
Progress on application of high-throughput sequencing in animal quarantine
1* 1 1 2
SUN Tao , LI Ming-Zhe , CUI Shu-Hua , YIN Wei-Li
(1. Shandong Entry-Exit Inspection and Quarantine Bureau, Qingdao 266002, China; 2. Yantai Entry-Exit
Inspection and Quarantine Bureau , Qingdao 264000, China)
ABSTRACT: In the face of unpredictable, suddenly broken, rapidly spread epidemic, learning agent information
quickly and reflecting the pathogens diversity of samples is one of the core work for the national health authorities
and the port early warning. With the application of high-throughput sequencing technologies, monitoring complex
samples comprehensively is a good idea to trace or prevent animal epidemic. At present, the biggest difference
between the traditional way and the method of high-throughput sequencing in animal quarantine is that the
pathogenic microorganisms is regarded as a whole, which gets rid of the cultivation of a single
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