基因连锁分析1a.ppt

骨质疏松症的遗传学研究(part 2) Hong-Wen Deng, Ph.D. Osteoporosis Research Center Creighton University, Omaha, NE, USA 翻译者： violet39 (DXY) 孤立研究危险因子的局限性(1) 非胰岛素依赖型糖尿病（NIDDM）(Ghosh et al. 2000)：染色体20，11，2，10和6； 危险因子(Watanabe et al. 2000): 染色体3（禁食C-肽/葡萄糖），染色体10（急性胰岛素反应），染色体13（体重指数和2-h胰岛素），染色体17和19（实验胰岛素抵抗指数）。 心肌梗死(Broeckel et al., 2002)：染色体14。 危险因子(Broeckel et al., 2002)：染色体1和6（脂蛋白A），染色体14，17（低密度脂蛋白胆固醇浓度），染色体1（高密度脂蛋白胆固醇浓度），染色体9（甘油三酯浓度），染色体6（Ⅱ-型糖尿病），染色体6（收缩期高血压），染色体1（舒张期高血压）。 DNA微阵列分析举例 鉴定了在鼠间质祖细胞分化过程中，成骨细胞中被诱导的9个新基因和EST序列 (Vaes et al., 2002)。 蛋白质组学研究 ~30,000基因，150万蛋白； 分析基因产物功能（大规模鉴定或定位蛋白，并且研究蛋白-蛋白相互作用）； 将基因表达和细胞代谢及功能以及遗传图谱联系起来。 * 基因连锁分析(1a) 基因连锁分析(1b) 595对独立的卵生同胞(Koller et al. 2000) 和包含630人的53个家系(Deng et al. 2002)的遗传度(power)分析 A：重组率＝0 B：重组率＝0.05 基因连锁分析(2) 基因连锁分析(3) 基因连锁分析(4) 基因连锁分析(5) 注解： 孪生同胞的遗传度(power)要求达到80％(当LOD为3.0时) 小鼠QTL定位 通过假定人类同源染色体定位进行 动物模型QTL分析 通过假定人类同源染色体定位进行 动物模型QTL分析 通过假定人类同源染色体定位进行 动物模型QTL分析 通过假定人类同源染色体定位进行 动物模型QTL分析 精细定位(~30cM到~1cM)(Deng et al., 2000)排除定位(Deng et al., 2001) 研究什么表型？ 两个复杂性状间的相互关系 孤立研究危险因子的局限性(2) DNA微阵列分析 *