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贵阳地区2013年手足口病非EV71、非CVA16型肠道病毒的检测分析.pdf
重庆医学 2016年 6月第45卷第 17期 2343
论著 ·临床研究 doi:10.3969/j.issn.1671—8348.2016.17.012
贵阳地 区2013年手足 口病非 EV71、非 CVA16型肠道
病毒的检测分析
杨兴林 ,梁跃东 ,洪章萍 ,熊金凤 ,王云芬 ,黄 海
(1.贵州省贵阳市第五人民医院检验科 550004;2.贵阳医学院检验系,贵阳 550004)
[摘要] 目的 了解贵阳地区引起手足 口病(HFMD)的非肠道病毒 7l型(EV71)、非柯萨奇病毒 A(CVA)16型肠道病毒的
病原构成及优势型别,为贵阳地区HFMD防治工作提供依据。方法 收集 2013年 4~6月检测为非EV71、非CVA16型肠道病
毒 的HFMD患者肛拭子标本共 107例 。提取病毒核酸 ,用巢式 RT-PCR法扩增病毒 VP4区序列,对 PCR阳性扩增产物进行测
序,通过与GenBank收录的序列BLAST 比对确定病毒型别;并对优势型别进行序列和进化分析。结果 107例标本中共有 100
例标本巢式RT-PCR检测为阳性(93 ),其中100例PCR产物测序成功,经BLAST比对后,100例标本病毒型别均得到确定:
CvA6为46例 ,CVA10为 3O例 ,cVA5为 10例 ,CVA2为 6例 ,CVA3和 CVA4各 2例 ,CVB2和 ECHO16各 2例 。CVA6在型
别确定的非EV71、非CVA16型肠道病毒中占42.99 ,为优势肠道病毒型别。结论 贵阳地 区引起 HFMD的肠道病毒型别多
样 ,cVA6为非 EV71、非 CVA16型肠道病毒 中的优势型别 。
[关键词] 手足 口病;肠道病毒;基因型
[中图分类号] R512.5 [文献标识码] A [文章编号] 167卜8348(2016)17—2343—03
Etiologystudyofhand,footandmouth diseaserelatednon-EV71,non-CoxA16enterovirusesinGuiyangareaduring2013
YangXinglin ,LiangYuedong ,HongZhangping ,XiongJinfeng ,WangYunfen ,HuangHai
(1.DepartmentofClinicalLaboratory,theFifthPeoplesHospitalofGuiyang,Guiyang,Guizhou550004,
China;2.DepartmentofMedicalTest,GuiyangMedicalCollege,Guiyang,Guizhou550004,China)
[Abstract] Objective Toexploretheprevalenceofnon—EV71,non—CoxA16enterovirusesstrainsofhand,footandmouth
disease(HFMD)inGuiyang,andanalyzethegeneticevolutionofthesenon-EV71,non-CoxA16enterovirusesstrain,andtoprovide
abasisforpreventingandcontrolling (HFMD)inGuiyang.Methods A totalof107HFMD specimenstestedpositiveforentero—
virusesandnegativeforEV71andCoxA16werecollectedfrom ApriltoJuneof2013.ThevirusRNA wasextracted,andtheVP4
sequencewasamplifiedbynestedRT—PCR.ThePCR positiveproductsweresequencedandtheenterovirusestypewasidentifiedby
sequenceBLAST.Thesequenceandphylogeneticanalysisofthepredom
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