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UVPGelDocitCOHU相机凝胶成像系统操作说明崔建国
UVP GelDoc-It+COHU相机凝胶成像系统操作说明操作说明:
– Filters – Rotate
亮度对比度调整:View-PlugIns-Image Contrals
噪声去除:Image – Filters – Starfield subtraction
凝胶图片分析操作说明(以自带图片为例):
打开VisionWorks LS 软件;
选择选择管理员身份或用户ID,直接点击LOGIN键;如果要输入密码,输入12345进入;
选择File Open Demo Images;
打开图片 DNA Monochrome.TIF,双击图片,可最大显示该图片;
从VIEWPLUGINS中选择1D Analysis、Zoom/Pan等工具条, 屏幕显示对应工具栏;
选择分析区域:点击图标中的按钮,用鼠标拖拉选择分析区域,不包含加样槽。
确定分析的泳道和条带:选择 Master tools Find lanes and bands 查找条带;拖动LANE 和 BAND 下的滑钮,可以找到比较合适的结果,退出该窗口;根据分析的内容, 点击 Edit objects 可以手动调节分析泳道的宽度、长度,利用 Lane tools 可以增加泳道; 利用Band tools 可以增加或删除条带。
可以验证目标条带位置的准确性:确定好Lane 和 Band后, 一般就可以继续下步分析; 如果需要验证Band区域的准确性, 可以点击 Settings Analysis settings , 选择窗口中的 Band extents, 可以看到每个Band的边界. 如果需要调整Band 区域的大小, 可以直接拖动Band 边界; 也可以打开 Lane profile grap 来对照调节.
分子量测定: 首先设定Marker 的分子量。单泳道的Marker, 需设定对应泳道各Band的分子量, 可调用或新建分子量的标准 ; 找到合适的标准后,Next 继续,Tag all 设置分子量,点 OK 退出。Marker 的分子量也可以新建, 可在STANDARD窗口点击 ADD 新建。注意事项:输入自定义的名称, 选择分子量单位, 输入每个BAND的分子量, 个数与Marker中BAND的个数相同,并从大到小排列, 保存后选择对应的标准,Next 继续,Tag all 设置分子量,点 OK 退出。
背景扣除: 多种方式可选, 大多数情况下可以用Rolling disc方式并选用合适的disc半径可以达到满意的结果. 操作时可修改disc 半径,使各个band 的峰与背景分开.
浓度测定: 首先建立浓度的标准曲线, 点击concentration 可以进入浓度曲线建立窗口; 选择已知浓度的Band, 并输入相应的浓度值,可以得到标准曲线, r2 值越接近1越好;关闭该窗口, 其余各Band的浓度值在结果中将给出.
查看结果: 点击DATA EXPLORE, 得到上图; 左侧是数据选择项, 右侧是数据结果。如果不需要某部分的数据,可以在左侧将勾去掉,右侧就不显示结果;如果要看某部分的数据,可以点击对应数据组的+图标。从上到下,依次有文件名、分析方法、LANES 数据、BANDS数据、浓度数据,以及分子量数据。所有数据可以导出到EXCEL。
数据结构:导出到EXCEL的数据表,左侧是层级,1、2、3表示第几层数据,+、- 符号表示是否展开;右侧是实际结果。要观看方便,需要调整一下间距,可以点击左上角选中全部数据,双击某列的线,可以比较适合观看。
打印报告:一种方式采用EXCEL的界面选择数据打印;另一种方式是在选择TOOLS REPORT, 出现对话框,左侧是输出的内容选择,右侧输入上下标。建议输出结果前先预览,以免打印太多。
注意事项:
联系电话: 8 0 0 8 1 0 7 8 9 0
本仪器试用期已过,暂时无法使用!
等厂家工程师注册之后,在使用!
谢谢配合!
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