侵染落葵的黄瓜花叶病毒分离物CP基因序列分析.PDF

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侵染落葵的黄瓜花叶病毒分离物CP基因序列分析

中国生物工程杂志 ChinaBiotechnology,2008,28(2):96~100 侵染落葵的黄瓜花叶病毒分离物 CP基因序列分析 牛立霞 牛胜鸟 王健华 刘志昕 (中国热带农业科学院热带生物技术研究所 热带作物生物技术国家重点实验室 海口 571101) 摘要 通过间接酶联免疫法(IDELISA)检测到染病落葵病样中存在黄瓜花叶病毒(cucumber ? mosaicvirus,CMV)。从病叶中提取总RNA,用RTPCR方法扩增得到657bp的CMVCP基因片 ? 段,将扩增产物与T载体连接并进行测序。用DNAMAN将得到的CP基因序列与GenBank收录 的黄瓜花叶病毒两亚组部分株系或分离物的CP基因序列进行比较,结果表明该CP基因与CMV 亚组 、亚组 之间的核苷酸序列同源性分别为91.17%~95.43%和75.30%~75.76%,推导氨 Ⅰ Ⅱ 基酸序列同源性分别为95.41%~97.71%和81.28%~81.74%,表明CMVBa与亚组 同源关 ? Ⅰ 系密切。 关键词 落葵 黄瓜花叶病毒 CP基因 序列分析 中图分类号 Q78   落葵(BasellarubraL.)属落葵科植物,为一年生 状的落葵植株上采集了病叶,得到病毒分离物(CMV? 藤本植物,俗名木耳菜、藤菜、承露、胭脂菜、御菜等,在 Ba),并将克隆得到的CMVBa外壳蛋白 (coatprotein, ? 我国各地均有栽培,亚洲其它地区、非洲、美洲也有分 CP)基因与已报道的CMV2个亚组的部分成员的CP [1] 布 。落葵不仅具有质地嫩滑、味道鲜美、营养丰富等 基因进行了序列分析和比较。 特点,而且还具有一定的清凉解热、解毒缓泄功能,可 1 材料与方法 算是一类药菜两用的蔬菜,深受广大人民的青睐,而且 成为宾馆饭店餐桌上具有新口味的高档蔬菜[2]。 1.1 材 料   但在生产过程中,无论采用何种栽培模式,落葵都 1.1.1 材料 罹病材料采自海南海口的菜地,置于- 或轻或重受到多种病害的危害。已见报道的有顶套菌 20℃冰箱保存备用。 [3] [2] [2,4~7] 1.1.2 抗血清和酶标抗体 一抗为本实验室制备的 属 、炭疽菌属和叶点霉属 、尾孢属 、琏格孢属 [8] [9] CMV亚组 多克隆抗血清B,酶标记羊抗兔 IgG为博 和色二孢属 以及短小杆菌属 真菌引起的叶斑病, Ⅰ 3 [2,6] 士德生物工程有限公司生产的碱性磷酸酯酶标记的 腐霉属真菌引起的霜霉病 ,葡萄孢属真菌引起的灰 [2,5,6] [10] 二抗。 霉病 ,根结线虫引起的根结线虫病 ,而落葵病 [11] 1.1.3 酶与试剂 AMV逆转录酶、RNA酶抑制剂 毒病,仅见2006年Huang等 报道马铃薯Y病毒引起 的皱缩花叶病。这些病害严重影响了落葵的品质和产 (Rnasin)、dNTPs为TaKaRa公司产品,TaqDNA聚合酶 量,制约了农民栽培的积极性。其中,近几年落葵花叶 购自Promega公司,PCR产物回收试剂盒为TIANGEN 病发生普遍,种植效益随之下降。为了确定海南落葵 公

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