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DTI 后处理
zhang zhipeng
MR Department
August 31, 2012
FiberTrack后处理
2
启动软件
在图像索引中选择任意DTI数据,点击右键,选择Fiber Track 软件包。
(至少需要6个弥散梯度施加方向,如果是15个或32个方向,纤维束的计算会更准确。确保在数据分析前运行 Diffusion Registration 软件包, 进行必要的运动校正,自动生成一个以Reg开头的新序列。)
3
大的浏览窗是一个交互式3D浏览窗口,用以显示解剖和纤维束信息。矩形浏览窗是作为位置参考,彩色线提示所显示矩形窗层面所在的位置。3D图像显示的层面与矩形浏览窗口的层面可实时关联。
界面简介
4
从图像索引窗拖拉一组解剖数据到软件中,解剖图可以和FA图的颜色相融合
图像融合
5
浏览图像
FiberTrak软件包有多种浏览的能力,包括旋转,修改浏览窗的显示以及翻阅数据。
1、若要转动数据到任意一个方向,按住鼠标右键,在3D窗口移动鼠标。
6
浏览图像
通过点击相应的按键可以显示或隐藏横断、矢状或冠状位图像。
7
浏览图像
如要回到未旋转的原始方位,在3D图像上点击右键,选择Switch to view然后选择横断、矢状或冠状位。
8
如要修改3D浏览窗口的显示图像类型,点击鼠标右键快捷菜单的Settings选项,再点击3D slices 栏, 通过选择相应的图像类型, 浏览窗口会实时更新。
浏览图像
翻阅数据,可以通过拖动矩形中的彩线或者按住鼠标左键,在3D窗口移动鼠标。
9
纤维束示踪
单个感兴趣区纤维束示踪技术
通过浏览图像找到最适合画感兴趣区的层面,执行单个感兴趣区纤维束追踪,点击Select next Interaction mode旁的箭头,然后选择Track Single ROI Fibers。
10
纤维束示踪
单个感兴趣区纤维束示踪技术
手动画感兴趣区,按住鼠标左键开始定义感兴趣区,移动鼠标开始画ROI,画完后释放鼠标,感兴趣区的纤维束就会立刻重建出来。
11
多个感兴趣区纤维束示踪
纤维束示踪
点击Select next Interaction mode旁的箭头,然后选择Define multiple ROIs。
12
纤维束示踪
多个感兴趣区纤维束示踪
用手画工具定义一个感兴趣区,滑动层面位置寻找到第二个感兴趣所在 的层面,定义另外一个感兴趣区。
13
纤维束示踪
多个感兴趣区纤维束示踪
点击Track multiple ROI fibers键来示踪纤维束。确保需要的ROIs都是显示出来的,因为只有显示的ROI会被计算。
14
旋转浏览3D图像,得到纤维束显示最佳的位置,必要时可以显示或隐藏横断、冠状或矢状位。
多个感兴趣区纤维束示踪
纤维束示踪
15
在这种状态下,鼠标左键是用来画感兴趣区的,如果要翻阅层面,需要设Interaction mode 到Scroll,另外也可以通过鼠标右键菜单,选择Scroll。
多个感兴趣区纤维束示踪
纤维束示踪
16
为了显示更多的感兴趣区类型和特征,可以选择删掉已经存在的纤维束和感兴趣区。选择纤维束说明后点右键,点击Select all 以及Delete。点击ROI说明后点右键,点击Select all 以及Delete。同时菜单中还有显示和隐藏选项,方便纤维素显示。
纤维束示踪
多个感兴趣区纤维束示踪
测量FA值
点击Fiber旁的箭头,可出现ROI和Fiber相关统计信息。
测量FA值
图中显示 ROI的像素大小,FA值的大小。第一栏还可以Fiber的相关统计结果,点击右键 Save Statistics可将统计结果以文件形式保存在电脑硬盘上。
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