多肽定量构效关系建模方法-重庆理工大学学报.pdf

第２５卷　第５期 重 庆 理 工 大 学 学报（自然科学） ２０１１年５月 Ｖｏｌ．２５　　Ｎｏ．５ ＪｏｕｒｎａｌｏｆＣｈｏｎｇｑｉｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ（ＮａｔｕｒａｌＳｃｉｅｎｃｅ） Ｍａｙ２０１１  多肽定量构效关系建模方法 １，２ ２ ２ １ 张　娅 ，丁　元 ，王远强 ，王伯初 （１．重庆大学 生物工程学院，重庆　４０００３０；２．重庆理工大学 药学与生物工程学院，重庆　４０００５４） 摘　　　要：列举了苦味肽、血管紧张素转换酶抑制剂和抗菌肽３种常用于ＱＳＡＲ建模的多肽 体系，介绍了几种ＱＳＡＲ常用建模方法：多元线性回归（ＭＬＲ）、偏最小二乘法（ＰＬＳ）、支持向量 机（ＳＶＭ）、主成分分析（ＰＣＡ）、逐步线性回归（ＳＬＲ）和人工神经网络（ＡＮＮ），为将从事多肽 ＱＳＡＲ研究合理选择建模方法提供有参考。 关　键　词：多肽；定量构效关系；常用体系 中图分类号：Ｑ５１６　　　　文献标识码：Ａ 文章编号：１６７４－８４２５（２０１１）０５－００３５－０７ ＲｅｓｅａｒｃｈｏｎＭｏｄｅｌｉｎｇＭｅｔｈｏｄｏｆＱｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅＳｔｒｕｃｔｕｒｅａｃｔｉｖｉｔｙ ＲｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐｆｏｒＰｅｐｔｉｄｅｓ １，２ ２ ２ １ ＺＨＡＮＧＹａ ，ＤＩＮＧＹｕａｎ，ＷＡＮＧＹｕａｎｑｉａｎｇ，ＷＡＮＧＢｏｃｈｕ （１．ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＢｉｏｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，ＣｈｏｎｇｑｉｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙ，Ｃｈｏｎｇｑｉｎｇ４０００３０，Ｃｈｉｎａ； ２．ＣｏｌｌｅｇｅｏｆＰｈａｒｍａｃｙａｎｄＢｉｏｅｎｇｉｎｅｅｒｉｎｇ，ＣｈｏｎｇｑｉｎｇＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙｏｆＴｅｃｈｎｏｌｏｇｙ，Ｃｈｏｎｇｑｉｎｇ４０００５４，Ｃｈｉｎａ） Ａｂｓｔｒａｃｔ：Ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅｓｔｒｕｃｔｕｒｅａｃｔｉｖｉｔｙｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ（ＱＳＡＲ）ｏｆｔｈｅｄｅｓｉｇｎｏｆｄｒｕｇｓａｎｄｐｅｐｔｉｄｅｓ ｐｌａｙｓａｃｒｉｔｉｃａｌｒｏｌｅ．Ｔｈｉｓｐａｐｅｒｌｉｓｔｅｄｔｈｒｅｅｓｏｒｔｓｏｆｔｈｅｐｅｐｔｉｄｅｓｓｕｃｈａｓｂｉｔｔｅｒｔａｓｔｉｎｇｐｅｐｔｉｄｅ，ａｇｉｏｔｅｎ ｓｉｎｃｏｎｖｅｒｔｉｎｇｅｎｚｙｍｅｉｎｈｉｂｉｔｏｒａｎｄｂａｃｔｅｒｉｃｉｄａｌｐｅｐｔｉｄｅｓ，ａｎｄｔｈｏｓｅｗｅｒｅａｌｗａｙｓｕｓｅｄｔｏＱＳＡＲｍｏｄｅｌ ｉｎｇｓｙｓｔｅｍｓ．ＴｈｅｐａｐｅｒｂｒｉｅｆｌｙｉｎｔｒｏｄｕｃｅｄｓｅｖｅｒａｌＱＳＡＲｍｏｄｅｌｉｎｇｍｅｔｈｏｄｓｉｎｃｏｍｍｏｎｕｓｅ，ｓｕｃｈａｓ ｍｕｌｔｉｖａｒｉａｔｅｌｉｎｅａｒｒｅｇｒｅｓｓｉｏｎａｎａｌｙｓｉｓ（ＭＬＲ），ｐａｒｔｉａｌｌｅａｓｅｓｑｕａｒｅｓ（ＰＬＳ），ｓｕｐｐｏｒｔｖｅｃｔｏｒｍａｃｈｉｎｅ （ＳＶＭ），ｐｒｉｎｃｉｐａｌｃｏｍｐｏｎｅｎｔａｎａｌｙｓｉｓ（ＰＣＡ），ｓｔｅｐｗｉｓｅｌｉｎｅａｒｒｅｇｒｅｓｓｉｏｎ（ＳＬＲ）ａｎｄａｒｔｉｆｉｃｉａｌｎｅｕｒａｌ ｎｅｔｗｏｒｋ（ＡＮＮ）．ＶａｌｕａｂｌｅｒｅｆｅｒｅｎｃｅｉｓｏｆｆｅｒｅｄｔｏＱＳＡＲｏｆｐｅｐｔｉｄｅｓｒｅｓｅａｒｃｈｆｏｒｓｅｌｅｃｔｉｎｇｃａｌｃｕｌａｔｉｏｎ ｍｏｄｅｌｉｎｇｍｅｔｈｏｄ． Ｋｅｙｗｏｒｄｓ：ｐｅｐｔｉｄｅｓ；ｑｕａｎｔｉｔａｔｉｖｅｓｔｒｕｃｔｕｒｅａｃｔｉｖｉｔｙｒｅｌａｔｉｏｎｓｈｉｐ；ｃｏｍｍｏｎｓｙｓｔｅｍｓ 　　收稿日期：２０１１－０２－０６；修回日期：２０１１－０３－１５ 基金项目：重庆市自然科学基金资助项目（ＣＳＴＣ，２０１０ＢＢ５３０６） 作者简介：张娅（１９８０—），女，