核酸和蛋白质序列的数据发掘-北京大学学报(医学版).PDF

北 京 大 学 学 报 （ 医 学 版 ） ]^P*;)_ ^( ,I‘Z;J P;ZaI*Z’K（HI)_’H .ZI;.I ） a3MW ! ;3W B )68W /$$ ·! · ·论著 · 人程序化死亡分子! （!#! ）核酸和蛋白质序列 的数据发掘 ! 郑 霙 ，马大龙 （北京大学人类疾病基因研究中心，北京 #$$$% ） ［关键词］序列同源性；生物信息学；’()*#+ ；,-.-! ［摘 要］目的：以程序化死亡分子!（!#! ）为靶分子，对其核酸与蛋白质序列进行生物信息学分析，为!#! 功能的实验研究提供基础，同时也为人类功能基因的生物信息学分析提供新的技术路线。方法：利用数据库相似 性有哪些信誉好的足球投注网站、同源物结构比较、表达谱分析和查询基因“邻居”等技术进行数据发掘和数据综合分析。结果：发现人 !#$在#/ 号和! 号染色体上分别存在返座假基因（012034516738191 ），小鼠# 号染色体也存在小鼠,-.-! :-;) 的返座假基因。热自养甲烷杆菌的,-.-! 同源物、泛素及核糖体蛋白# 具有与人,-.-! 相似的折叠方式。线 虫的!#! 同源物、泛素及%! （=9=?=230 3@ A434235=5 40321=95 ）分子等在表达谱拓扑图上属于同一基因簇成员，该基 因簇与生物合成和蛋白质合成相关。 !#! 同源物在多个基因组中与多种核糖体蛋白相邻。结论：!#! 存在/ 个拷贝的假基因。!#! 除参与细胞凋亡外，预测还与泛素有功能相关性，并可能参与蛋白质的翻译调控。 ［中图分类号］*B ［文献标识码］) ［文章编号］#CD #E#CDF（/$$ ）$BE$!E$D ! #$%$’ !# $%%’ () #*+ *,$ -.(’.$$+! /+00 !+#* ! （()*)! ）1+2,+/+1 GHI;J K=98 ! ，L) -AM398 （.19210 @30 H6NA9 -=51A51 J193N=:5 ，,1O=98 P9=Q105=2R ，S1=T=98 #$$$% ，.=9A ） 345 6789: 1U619:1 3N3M38R ；S=3=9@30NA2=:5 ；’()*#+ ；,-.-! :;=85 7?+/#%@+ ：’3 MAR @3697A2=39 @30 21 @69:2=39AM 5267=15 3@ 40380ANN17 :1MM 71A2 ! （!#! ）A97 71Q1M34 91V 21:9=:AM 4A2VAR @30 ?=3=9@30NA2=:5 A9AMR5=5 3@ 6NA9 @69:2=39AM 81915W +#*(!1 ：P5=98 !#$ A5 21 2A0812 N3M1:6M1 ，=92195=Q1 ?=3=9@30NA2=:5 A9AMR5=5 3@ 21 96:M1=: A:=7 A97 40321=9 51U619:15 V101 :3976:217W -A2A N=9=98 A97 :3N401195=Q1 A9AMR5=5 ?R 51U619:1 A8A=952 7A2A?A51 5=N=MA0=2R 51A0:=98 ，3023M38 5206:2601 :3N4A0=539 ，1X40155=39 403@=M1 A9AMR5=5 A97 8191 “91=8?30 ”M=52E =98 V101 410@30N17W 8+1,0#1 ：’V3 6NA9 462A2=Q1 45167381915 39 :03N353N15 #/ A97 ! ，A97 391 N3651 462A2=Q1 4516738191 39 :03N353N1 # V101 =7192=@=17W ’1 N12A93?A:210=6N 210N3A6232034=E :6N 3023M38 VA5 :MA55=@=17 A5 21 5AN1 @3M7 A5 6?=U6=2=9 A97 0=?353NAM 40321=9 #W ’1 .W 1M18A95 30E 23M38 ，6?=U6=2=9 A97 %! （=9=?=230 3@ A434235=5 40