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广州市科学技术奖公示表
项目名称 基于ion torrent 测序平台的翻译组快速测序服务平台的研究 项目简介(限800字) (1) 技术领域:
本项目属于生物技术和医学诊断试剂领域。
(2)主要内容:
①核糖体-新生肽链复合物(RNC)的分离及其中mRNA捕获条件优化;
②RNC-mRNA高通量测序技术标准流程建立;
③建立翻译组测序数据分析平台,提供翻译组学快速测序与分析服务;
④开发RNC-mRNA提取系列试剂盒;
⑤开发RNC-mRNA高通量测序建库试剂盒(Ion Torrent平台)。
(3)特点及科学价值:
本项目对翻译组高通量测序技术流程进行优化,建立标准化服务流程,向市场上推广翻译组高通量测序技术服务;同时开发并生产核糖体-新生肽链复合物(RNC)提取系列试剂盒、RNC-mRNA高通量测序建库试剂盒;本项目的关键技术RNC-mRNA的提取方法为项目负责人首创,而目前国内尚未有翻译组学研究的技术服务及相关的试剂盒产品,因此本项目具有国内首创性。
目前质谱和抗体检测蛋白质的方法都需要基于已知蛋白质的序列,而对于发现“missing protein”却无能为力。近年来通过分析RNC-mRNAs以找到未知蛋白的编码序列及其表达信息成为发掘“missing protein”的有力工具,但RNC-mRNAs的提取首先需通过放线菌酮固定核糖体和mRNA,之后利用蔗糖密度梯度离心法收集RNC并提取RNC-mRNAs用于高通量测序。其提取技术复杂、对仪器设备和提取环境要求较高,普通生物实验室无法单独完成。本项目基于ion torrent高通量测序技术的翻译组RNC-mRNAs快速测序服务平台,通过RNC-mRNAs捕获试剂盒、翻译组高通量测序建库试剂盒以及高通量测序流程的开发,为高校、科研院所及企业提供翻译组学测序技术产品和服务。不仅更有利于翻译组RNC-mRNAs测序技术的推广应用,且对于发现更多“missing protein”并使之成为人类蛋白质组计划的有效补充都具有重要意义。
推广应用情况 本项目结合赛哲生物Ion torrent高通量测序技术平台以及暨南大学翻译组学实验室权威技术和理论指导,共同开发RNC-mRNAs捕获试剂盒(组织、血液、细胞)、翻译组高通量测序建库试剂盒以及高通量测序流程,并已成功在广东、福建、海南、北京、上海等十几个主要城市和地区实现产品和服务基础科学、临床研究方面的广泛应用。 主要完成人姓名 排名 职称 工作单位 对本项目的主要贡献及证明材料 金静洁 1 实验师 暨南大学(技术顾问) 翻译组学发明主要技术完成人、技术指导 无 暨南大学 生物信息学分析、技术指导 助理
研究员 广州赛哲生物科技股份有限公司 项目管理与测序技术攻关 无 广州赛哲生物科技股份有限公司 试剂盒产品研发 无 广州赛哲生物科技股份有限公司 产品和服务市场推广 无 广州赛哲生物科技股份有限公司 样品准备及高通量测序实验操作 无 广州赛哲生物科技股份有限公司 高通量测序实验操作 8 无 广州赛哲生物科技股份有限公司 生物信息学分析 广州赛哲生物科技股份有限公司、暨南大学 主要知识产权目录 知识产权类型 知识产权具体名称 授权国别(地区) 授权号/申请号 权利人 发明人 国家发明专利ZL201610534365.1 广州赛哲生物科技股份有限公司 伍泳彰 曾宏彬 陈杰 国家发明专利ZL201610534362.8 广州赛哲生物科技股份有限公司 伍泳彰 曾宏彬 陈杰
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