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植物微卫星分子标记中无效等位基因检测方法的比较-PlantDiversity
植 物 分 类 与 资 源 学 报 ２０１４ꎬ３６ (６):７２３~７２９
Ｐｌａｎｔ Ｄｉｖｅｒｓｉｔｙ ａｎｄ Ｒｅｓｏｕｒｃｅｓ ＤＯＩ:１０.７６７７/ ｙｎｚｗｙｊ２０１４１４０５３
植物微卫星分子标记中无效等位基因检测方法的比较与应用∗
１ꎬ２ １∗∗
侯 盟 ꎬ 杜 芳
(１北京林业大学林学院ꎬ 北京 １０００８３ꎻ ２ 兰州大学生命科学学院草地农业
生态系统国家重点实验室ꎬ 甘肃 兰州 ７３００００)
摘要: 微卫星分子标记因其开发便捷、 突变率高、 成本较低等优势一直被广泛应用于群体遗传学、 保护生
物学和分子生态学研究中ꎮ 近年来二代测序技术、 多重ＰＣＲ方法以及毛细管电泳等新技术的发展和完善ꎬ
极大地提高了微卫星分子标记的开发和使用效率并降低了使用成本ꎮ 但是在开展微卫星实验过程中普遍存
在的无效等位基因 (或称为哑等位基因ꎬ ｎｕｌｌ ａｌｌｅｌｅｓ) 会对研究结果造成偏差ꎬ 是微卫星分子标记应用中
的最大缺陷之一ꎮ 然而ꎬ 长期以来无效等位基因的检测问题并未受到研究者的足够重视ꎮ 本文通过对国内
外相关文献查阅ꎬ 在对无效等位基因有一个较为深入和全面认识的基础上ꎬ 对目前无效等位基因的主要检
测方法进行全面的介绍和深入的比较ꎮ 最后ꎬ 结合研究实例总结出植物微卫星分子标记研究中无效等位基
因检测的有效办法ꎮ
关键词: 无效等位基因ꎻ 微卫星ꎻ 哈温平衡法ꎻ 亲子代基因型法
－ － － －
中图分类号: Ｑ３ ３ꎬＱ７８５ 文献标识码:Ａ 文章编号:２０９５ ０８４５(２０１４)０６ ７２３ ０７
Ｎｕｌｌ Ａｌｌｅｌｅ Ｄｅｔｅｃｔｉｏｎ ｉｎ Ｐｌａｎｔ Ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅ Ｓｔｕｄｉｅｓ:
Ｃｏｍｐａｒｉｓｏｎｓ ａｎｄ Ａｐｐｌｉｃａｔｉｏｎｓ
１ꎬ２ １∗∗
ＨＯＵ Ｍｅｎｇ ꎬＤＵ Ｆａｎｇ
(１Ｃｏｌｌｅｇｅ ｏｆ ＦｏｒｅｓｔｒｙꎬＢｅｉｊｉｎｇ Ｆｏｒｅｓｔｒｙ ＵｎｖｅｒｓｉｔｙꎬＢｅｉｊｉｎｇ １０００８３ꎬＣｈｉｎａꎻ２ Ｓｃｈｏｏｌ ｏｆ Ｌｉｆｅ Ｓｃｉｅｎｃｅꎬ
Ｌａｎｚｈｏｕ ＵｎｉｖｅｒｓｉｔｙꎬＬａｎｚｈｏｕ ７３００００ꎬＣｈｉｎａ)
Ａｂｓｔｒａｃｔ:Ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅｓｒｅｍａｉｎｔｈｅｍｏｓｔｐｏｐｕｌａｒｍａｒｋｅｒｓｉｎｔｈｅｓｔｕｄｉｅｓｏｆｐｏｐｕｌａｔｉｏｎｇｅｎｅｔｉｃｓꎬｃｏｎｓｅｒｖａｔｉｏｎｂｉｏｌｏｇｙ
ａｎｄ ｍｏｌｅｃｕｌａｒ ｅｃｏｌｏｇｙ ｂｅｃａｕｓｅｏｆ ｉｔｓｅａｓｅｔｏ ｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔꎬｈｉｇｈ ｍｕｔａｔｉｏｎｒａｔｅ ａｎｄｌｏｗ￣ｃｏｓｔ. Ｎｏｗａｄａｙｓꎬｔｈｅ ｉｍｐｒｏｖｅ￣
ｍｅｎｔ ｏｆｎｅｗｔｅｃｈｎｏｌｏｇｉｅｓꎬｓｕｃｈａｓＮｅｘｔ￣ＧｅｎｅｒａｔｉｏｎＳｅｑｕｅｎｃｉｎｇ (ＮＧＳ)ꎬｍｕｌｔｉｐｌｅｘ￣ＰＣＲａｎｄｃａｐｉｌｌａｒｙｅｌｅｃｔｒｏｐｈｏｒｅｓｉｓ
ｓｙｓｔｅｍ ｈａｖｅ ｇｒｅａｔｌｙ ｐｒｏｍｏｔｅｄｔｈｅｄｅｖｅｌｏｐｍｅｎｔ ａｎｄｕｓｉｎｇｏｆ ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅｍａｒｋｅｒｓ. Ｈｏｗｅｖｅｒꎬｎｕｌｌ ａｌｌｅｌｅｓꎬｏｎｅｏｆ ｔｈｅ
ｍｏｓｔ ｐｒｉｍａｒｙ ｄｅｆｅｃｔｓ ｏｆ ｍｉｃｒｏｓａｔｅｌｌｉｔｅ ｍａｒｋｅｒｓꎬｗｉｄｅｌｙ ｐ
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