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信号肽酶21启动区SNP分布及其与HBV感染转归的关系
信号肽酶复合物21基因启动区SNP分布及其与HBV感染转归的关系
韩宗萍1,时红,2,彭晓谋2
1、中山大学附属第医院
2、中山大学附属第三医院肝脏病学实验室,广州 510630
3、中山大学附属第三医院感染科,广州 510630
通讯作者:彭晓谋 xiaomoupeng@
基金资助和广东省自然基金重点项目
The occurrence and its relationship with HBV infection outcome of single nucleotide polymorphisms in promoter of signal peptidase complex 21 gene
HAN Zong-Ping1 ZHU Yin-Hong2 SHI Hong 3 PENG Xiao-Mou2.3
1. The Fifth Affiliated Hospital, Sun Yat-Sen University, People’s Republic of China;
2. Liver Disease Key Laboratory of Guangdong Province, Guangzhou, People’s Republic of China.
3. Department of Infectious Diseases, the Third Affiliated Hospital, Sun Yat-Sen University, People’s Republic of China;
Correspondence to: Xiao Mou Peng, xiaomoupeng@
信号肽酶21启动区SNP分布及其
与HBV感染转归的关系
【摘要】目的 了解中国汉族人信号肽酶复合物(SPC)21基因启动区单核苷酸多态性(SNP)的出现情况,探讨其与HBV感染转归的关系。方法 采集40例健康人、40例持续感染者和23例HBV自限性感染者的全血并提取全基因组DNA,以PCR技术扩增SPC21启动区约1200 bp的区域进行DNA序列分析。结果 在各组样本中SPC21启动区的SNPs位点-933(A/C)、-885(G/T)、-779(C/T)和-596(C/T)均存在多态性,而在-1189、-1180和-966位点未见多态性。与GenBank登记情况比较显示, -885(G/T)和-779(C/T)的基因型分布与登记数据类似。生物信息学分析提示-933(A/C)与-596(C/T)存在连锁关系。各SNP的基因型、等位基因和单体型的分布频率在健康人、持续感染者和HBV自限感染者中的差异无统计学意义。结论 在汉族人群中,SPC21启动区存在SNPs多态性,且有自身特点,但其基因型、等位基因和单体型分布与HBV感染转归无明显相关性。
【关键词】 乙型肝炎病毒;乙型肝炎e抗原;信号肽酶复合物;单核苷酸多态性;基因型
慢性乙型肝炎病毒(Hepatitis B virus,HBV)感染的形成和演变决定于病毒与宿主间的相互作用。在宿主方面,感染时的年龄是决定感染转归的关键因素[1]。然而,有人对相同年龄的感染者进行随访发现,个体遗传因素对HBV感染的转归产生影响[2]。个体遗传因素的基础主要为遗传物质在个体间的多态性,包括当前研究热点单核苷酸多态性(single nucleotide polymorphism, SNP)。HBeAg血清转换是HBeAg阳性慢性乙型肝炎预后评估和疗效观察的重要指标[1,3]。然而,目前临床上所用药物的这一疗效尚不理想。深入研究HBeAg形成相关机制可能是提高HBeAg血清转换的途径。HBeAg前体是由前C和C基因共同编码,其N端含信号肽序列,能引导肽链进入内质网。新合成的HBeAg前体首先在内质网被信号肽酶复合物(signal peptidase complex,SPC)切除信号肽序列,然后在反面高尔基体内被原蛋白转化酶furin切除C端的精氨酸富集区,最后分泌到细胞外,形成成熟的HBeAg。下调furin活性可抑制HBeAg的分泌[4]。课题组前期研究显示,furin基因P1启动子的一个SNP可影响基因的转录活性和HBV感染的转归[5]。SPC活性与HBeAg分泌,以及HBV感染转归的关系缺乏深入研究。然而有资料显示,HBV的信号肽序列发生变异会影响到SPC的切割[6],慢性乙型肝炎患者的血清中常出现“空病毒颗粒”,其衣壳是由保留信号肽的类核心蛋白构成[7]。以上提示,SPC活性可能对HBeAg成熟和HBV感染进程产生影响。SPC由SPC12、SPC18、SPC21、SPC22/23和SPC25等5个亚单位组成[8]
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