利用线粒体COI和微卫星标记分析文蛤7个地理群体的遗传-生态学报.PDF

第 36 卷第 2 期 生 态 学 报 Vol.36,No.2 2016年1月 ACTA ECOLOGICA SINICA Jan.,2016 DOI:10.5846/ stxb201409151822 李宏俊,张晶晶,袁秀堂,张安国,柳圭泽,邵魁双,王立俊.利用线粒体COI和微卫星标记分析文蛤7个地理群体的遗传变异.生态学报,2016,36 (2):499鄄507. Li HJ,ZhangJ J,Yuan X T,Zhang A G,Liu GZ,Shao K S,Wang LJ.Genetic diversity and differentiation of seven geographical populationsof hard clam (Meretrix meretrix) assessed by COI and microsatellite markers.Acta Ecologica Sinica,2016,36(2):499鄄507. 利用线粒体 COI和微卫星标记分析文蛤7个地理群体 的遗传变异 1 1,2 1,* 3 1 1 1 李宏俊 ,张晶晶 ,袁秀堂 ,张安国 ,柳圭泽 ,邵魁双 ,王立俊 1 国家海洋环境监测中心,大连摇 116023 2 大连海洋大学,大连摇 116023 3 辽宁医学院,锦州摇 121001 摘要:利用线粒体细胞色素氧化酶亚基I(COI)和微卫星标记分析了文蛤7个地理群体(朝鲜新义州,辽宁丹东、蛤蜊岗和盘山, 山东东营,江苏如东和启东)的遗传多样性和群体分化。 PCR扩增获得 142条602 bp 的COI核苷酸片段,比对到 13个变异位 点,包括 11个转换和2个颠换,定义了22个单倍型,共享单倍型12个,新义州、丹东和启东群体分别拥有特有单倍型。 单倍型 = = = 多样性最高的是如东群体(h 0.900),最低的是东营群体(h 0.600);核苷酸多样性最高的是丹东群体(仔 0.00350),最低的是 = 蛤蜊岗群体(仔 0.00115)。 基于COI数据的Fu忆s Fs 中性检验和核苷酸不配对分析揭示文蛤种群历史上曾经历过群体扩张事 件。 分子变异分析(AMOVA)表明,群体内遗传变异占71.64%,群体间遗传变异占28.36%,群体间发生显著的遗传分化(P 0.05)。 7个微卫星标记扩增280个个体共获得54个等位基因,平均等位基因数为7.7个,平均观测杂合度和期望杂合度分别 为0.3878和0.7996。 江苏群体具有较高的遗传多样性,但7个群体间遗传多样性不存在显著差异(Kruskal鄄Wallis检验,P 0.05)。 Hardy鄄Weinberg平衡检验结果显示49个群体鄄位点组合中有 18个偏离平衡(P0.05),表现为杂合子缺失。 单倍型邻接 (NJ)树显示聚类未展示地域性特色,但某几个同一或者相近地理群体的单倍型具有聚类现象(如东和启东部分单倍型出现地 理聚类)。 依据群体间遗传距离以Kimura2鄄parameter为模型建立 UPGMA 系统发育树,显示丹东群体和江苏的如东和启东群 体聚为一支,暗示江苏苗种的异地养殖已经污染丹东文蛤的遗传背景。 关键词:文蛤;群体遗传变异;细胞色素氧化酶亚基I;微卫星;增殖放流 Genetic diversity and differentiation of seven geographical populations of hard clam (Meretrix meretrix) assessed by COI and microsatellite markers 1 1,2 1,* 3 1 1 LI Hongjun , ZHANG Jingjin