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不同生境中沼泽红假单胞菌基因型多样性分析-微生物所期刊联合编辑部
微生物学通报 DEC 20, 2010, 37(12): 1836−1842
Microbiology China © 2010 by Institute of Microbiology, CAS
tongbao@
主编点评文章
不同生境中沼泽红假单胞菌基因型多样性分析
冯有智1,2 武敬1,2,3 王一明1,2 林先贵1,2*
(1. 中国科学院南京土壤研究所土壤与农业可持续发展国家重点实验室 江苏 南京 210008)
(2. 中国科学院南京土壤研究所 香港浸会大学土壤与环境联合开放实验室 江苏 南京 210008)
(3. 中国科学院研究生院 北京 100049)
摘 要: 沼泽红假单胞菌(Rhodopseudomonas palustris , R. palustris)是一种分布广泛的紫色非硫细
菌, 代谢方式的多样性赋予了它们重要的生态学意义和应用价值。从湖泊、池塘和河流的 11 个底
泥样品中富集培养紫色非硫细菌, 利用基于 pufM 基因的 PCR-DGGE 技术鉴定为 R. palustris , 再
利用 rep-PCR 技术进行基因型指纹图谱分析。结果发现相近生境, 即湖泊中的菌株基因型相似度
较高, ＞80%, 而差异越大的生境中菌株基因型指纹图谱差异也越大。这种基因型差异性分析不仅
可以帮助研究者更全面地了解不同环境中 R. palustris 基因型多样性, 也为进一步揭示其生态学意
义和进化过程提供基础。
关键词: 沼泽红假单胞菌, 紫色非硫细菌, PCR-DGGE, rep-PCR
The Genotype Diversity of Rhodopseudomonas palustris in
Different Habitats
FENG You-Zhi1,2 WU Jing1,2,3 WANG Yi-Ming1,2 LIN Xian-Gui1,2*
(1. State Key Laboratory of Soil and Sustainable Agriculture, Institute of Soil Science, Chinese Academy of Sciences,
Nanjing , Jiangsu 210008, China)
(2. Joint Open Laboratory of Soil and the Environment , Institute of Soil Science, Chinese Academy of Sciences and Hongkong
Baptist University , Nanjing , Jiangsu 210008, China)
(3. Graduate University of Chinese Academy of Sciences, Beijing 100049, China)
Abstract: Rhodopseudomonas palustris (R . palustris) is a common type of purple photot
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