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基于并行计算的大规模外显子芯片数据分析
张武军 刘学军 张 礼
南京航空航天大学计算机科学与技术学院南京
摘 要快速准确地计算出转录组表达水平对转录组研究具有重要的作用本文针对伽玛分布的概率
模型 在处理大规模外显子芯片数据集上效率低下的特点提
出一种充分利用多核处理机或者集群环境来提高效率的并行计算方法首先分析 模型的原理
其次分析模型并行算法的选择最后在不同规模的数据集上分析并行计算的效率通过实验验证了并
行计算极大地提高了模型的计算效率实验结果表明与先前的串行计算相比并行计算使得 模
型更适用于大规模的外显子芯片分析
关键词基因表达并行计算外显子芯片概率模型
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