序列相似性网络聚类与蛋白质家族划分.pdf

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2017-10-13 发布于天津
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研究论文序列相似性网络聚类与蛋白质家族划分时逢宽李炜疆江南大学工业生物技术教育部重点实验室江苏无锡江南大学生物工程学院江苏无锡摘要图聚类法是利用蛋白质序列信息推断其家族分类的有力手段对于蛋白质数据集中家族内外存在着如同许多超家族一样的复杂关系图聚类法达到较好表现必须两因素输入的相似性图需要包含有足够的用于分类的信息需要稳健的算法以识别被隐藏在相似性图中的模糊集团作者测试模块度最优算法算法采用来自于中的具有高度序列差异的烯醇酶宗族作为测试数据集结果表明使用算法在相关参数与相似性图比较恰当的情况下得

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