微生物次级代谢产物合成基因簇预测分析.pdf

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微生物次级代谢产物合成基因簇预测分析

微生物次级代谢产物及其生物 合成基因簇预测分析 antiSMASH 次级代谢产物及其生物合成基因簇简介 主 antiSMASH 分析方法及流程 要 内 容 antiSMASH 的优势与比较 次级代谢产物的分类鉴定概貌 2 微生物学发展史中四位重要人物 Louis Pasteur Alexander Fleming Selman worksman Francisco Malpartida 法国人,开创 苏格兰人,发现青霉 美国人,对土壤微生 西班牙人,于1984年, 了微生物技术 素及其治疗传染性疾 物产生抗生素物质进 第一个克隆了放线紫 的新时代 病的功效,1945年获 行了系统和开创性工 红素的完整合成基因 得诺贝尔生理医学奖 作,发现了抑制肺结 簇 核的链霉菌素,1952年 获得诺贝尔生理医学 奖 3 次级代谢产物简介 次级代谢产物:微生物生长到一定阶段才产生的化学结构十分复 杂、对该生物无明显生理功能,或并非是微生物生长和繁殖所必 需的物质 主要来源:放线菌、真菌等 Zwittermicin A 4 次级代谢产物简介 polyketides (type I) polyketides (type II) polyketides (type III) 聚酮(PK) nonribosomal peptides terpenes lantibiotics 非核糖体肽(NRP) 萜烯 羊毛硫抗生素 aminoglycosides / bacteriocins beta-lactams aminocyclitols 细菌素 β- 内酰胺 氨基糖甙类/氨基环醇 aminocoumarins siderophores ectoines 基香豆素 铁载体 四氢嘧啶 butyrolactones indoles nucleosides 丁内酯 吲哚类 核苷 phosphoglycolipids melanins

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