真核生物基因结构的预测分析-HE.pdf

真核生物基因结构的预测分析 1 基因组功能分析 蛋白质理化性质 二级结构预测 翻 结构域分析 基因组序列 编码区预测 译 蛋白质序列 重要信号位点分析 cDNA序列 三级结构预测 基因结构分析 序列比对 功能注释 KEGG GO Codon bias 选择性剪切 系统发育树 GC Content 限制性酶切位点 转录调控因子 2 基因预测  DNA序列中编码区的鉴定  预测方法的依据:  编码统计学：编码区序列同非编码区序列相比，有 不同的特点，存在一些非随机的特点  GC 含量  密码子偏倚性 (CODON FREQUENCY)  第三个碱基组成  基因结构/统计学方法  比较/同源性 原核生物基因结构 Gene structure of prokaryote 转录区transcribed region 起始密码子 终止密码子 initiation codon termination codon 5’ 编码区 3’ RBS 启动子Promoter 非翻译区 untranslated region, UTR 转录终止位点(TTS) 转录起始位点(TSS) Transcription termination site transcriptional start site 真核生物基因结构 Gene structure of eukaryota 转录区transcribed region 外显子exon 起始密码子 终止密码子 内含子intron initiation codon termination codon 5’