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下一代测序技术与其他技术平台
第二部分：
下一代测序技术与其他技术平台
孟山都现代SNP分子标记辅助的精确耕种
种子（条形码编码）切割机器人 种植带有优良基因型
基因型选种
道格拉斯Array Tape利用SNP分子
从种子上取一小块组织 标记对几万颗种子鉴定基因型
基因组选择(Genomic selection)辅助的精确育种策略
农艺性状优良品种 候选育种材料的收集(农家)
(训练群体~100) (候选群体 ~10,000)
基因组选择预
测模型的构建
1. 线性回归模型
基因组测序(基因型) 基因组测序(基因型)
候选材料的育种价
鉴定控制优良性状的基因型 值 (GEBV)评估 选择育种价值较高的材料
(基因组关联分析) (实验群体 ~100)
对产量、抗性等性
谱 状进行预测
图 周期从7到8年缩短到3到5年
锁
连 0
设计大田育种实验方案
状
性
-
因
基
一、二、三代测序技术原理介绍
2, 3代一般统称为Next Generation
Sequencing (NGS)
测序技术发展里程
第一代测序：Sanger法测序， 1970年，30亿美元测人类基因组（一条1 Kbp DNA序列）
第二代测序：(或新一代Next Generation，或高通量测序High-throughput sequencing，或并
行测序Parallel sequencing, 或深度测序Deep sequencing，或边合成边测序
Sequencing by Synthesis, 等很多名称)
1. 454焦磷酸测序2004 （几万条读长＝200~500nt ）
2. Solexa测序2006 （几百万读长＝36nt ）
3. ABI SOLiD测序2006 （几百万读长=50nt ）
4. Illumina GA II 2007 (几千万条读长=70
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