利用公共数据进行课题申请.pdf

GCBI助力国自然申请及课题设计 国自然申请、课题设计如何利用公共数据 ——GCBI基因云平台 Gene Cloud of Biotechnology Information WWW.GCBI. 魏 倩（GCBI咨询顾问） 上海其明信息技术有限公司 每周四晚8点 腾讯在线课堂 相约GCBI课堂 参加方法：关注 微信 QQ GCBI公众号、 加入QQ群 腾讯在线课堂上 有哪些信誉好的足球投注网站“GCBI” “4W”问题 Why ：为什么要申请基金项目？ 为了解决某一科学问题-选题依据； 为什么要解决该科学问题，有什么科学意义-立论依据 What ：为了解决该科学问题，应该做什么？-研究目标和研究 内容 How：如何做？-研究方案和技术路线 Who ：为什么由你来做？-工作基础和个人简介 Idea很重要！ 一个理想的研究对象很重要！ 如何寻找研究对象？ 查阅文献-热点 （它是否在我的研究领域里也有作用？） 已有的工作基础-延伸 （没有相关样本数据，怎么办？） 公共数据数量庞大 随着高通量检测技术的 飞速发展，积累了大量 的基因表达数据。单看 GCBI 的统计结果，目前 有2400多万篇文献， 120多万份基因大数据， 8万多份肿瘤样本数据。 公共数据的应用 公共全基因数据 发现新基因 基因的调节机制 基因检测 基因信息 适合疾病的药物 药物的作用机理 两个核心问题 怎样找到有价值的数据？ 这样的数据怎么使用？ 实例讲解——如何找到target 1.基因 2.lncRNA 浸润性导管癌（IDC）：乳腺癌中最常见的一种类型，约占70%。 导管原位癌（DCIS）：乳腺癌0期。 DCIS IDC 支持17款Affymetrix芯片的在线 分析： 人、大鼠、小鼠的表达谱芯片 多样本 联合分析 平台类型及总 样本具体情况 体情况介绍 描述 分析流程 新建实验室