生物统计学试验指导.pdf

《生物统计学》试验指导（R 语言版） 《生物统计学》试验指导 （R语言版） 江西农业大学生物工程系 《生物统计学》试验指导（R 语言版） R语言概述 R是属于GNU系统的一个自由、免费、源代码开放的软件，它是一个用于统计 计算和统计制图的优秀工具。 R是S语言的一种实现。S语言是由ATT 贝尔实验室开发的一种用来进行数据探 索、统计分析、作图的解释型语言。最初S语言的实现版本主要是S-PLUS 。S-PLUS 是一个商业软件，它基于S语言，并由MathSoft公司的统计科学部进一步完善。后来 Auckland 大学的Robert Gentleman 和 Ross Ihaka 及其他志愿人员开发了一个R系 统。R 的使用与S-PLUS有 多类似之处，两个软件有一定的兼容性。S-PLUS 的使用 手册，只要经过不多的修改就能成为R 的使用手册。所以有人说：R ，是S-PLUS 的 一个 克隆”。但是请不要忘了：R is free 。 R是一套完整的数据处理、计算和制图软件系统。其功能包括：数据存储和处 理系统；数组运算工具 （其向量、矩阵运算方面功能尤其强大）；完整连贯的统计分 析工具；优秀的统计制图功能；简便而强大的编程语言：可操纵数据的输入和输入， 可实现分支、循环，用户可自定义功能。 与其说R是一种统计软件，还不如说R是一种数学计算的环境，因为R并不是仅 仅提供若干统计程序、使用者只需指定数据库和若干参数便可进行一个统计分析。 R 的思想是：它可以提供一些集成的统计工具，但更大量的是它提供各种数学计算、 统计计算的函数，从而使使用者能灵活机动的进行数据分析，甚至创造出符合需要 的新的统计计算方法。 R是一个免费的自由软件，它有UNIX、LINUX 、MacOS和WINDOWS版本，都 是可以免费下载和使用的。R 的主要网站是http ://www.r-proj 。在那儿可以下载 到R 的安装程序、各种外挂程序和文档。在R 的安装程序中只包含了8个基础模块， 其他外在模块可以通过CRAN获得 （http :// ）。 以下简述R FOR WINDOWS 的安装和使用： 在网址：http ://cran .r-proj 下可以找到R 的各个版本的安装程序和源代码。 点击进入：Windows (95 and later) ，再点击：base，下载SetupR.exe ，约18兆，此便 是R FOR WINDOWS 的安装程序。双击SetupR.exe ，按照提示一步步安装即可。 安装完成后，程序会创建R程序组并在桌面上创建R主程序的快捷方式 （也可以 在安装过程中选择不要创建）。通过快捷方式运行R ，便可调出R 的主窗口 （如下图 1-1 ）。 类似于许多以编程方式为主要工作方式的软件，R 的界面简单而朴素，只有不 多的几个菜单和快捷按钮。快捷按钮下面的窗口便是命令输入窗口，它也是部分运 算结果的输出窗口，有些运算结果则会输出在新建的窗口中。 主窗口上方的一些文字是刚运行R 时出现的一些说明和指引。文字下的： 符 号便是R 的命令提示符，在其后可输出命令；后的矩形是光标。R一般是采用交互 方式工作的，在命令提示符后输入命令，回车后便会输出结果。 1 《生物统计学》试验指导（R 语言版） 第一节 数据的输入 注：在R中，大小写是敏感的，即大小写是不同的。 一、变量数据直接输入 1、数值变量 如果有一个变量，变量名为x ，其数据如下：12，15，46 ，23 ，15。命令语句如 下： x-c(12,15,46,23,15) 或 c(12,15,46,23,15)-x 其中：x为变量名；-与-为赋值符；c( )为向量建立函数，表示把括号中的数 据建立为一个向量。 以上命令语句建立了一个数值变量x 。 2、字符变量 字符变量的建立与数值变量一致。字符串使用引号 （单、双 可），如： y-c( er