chembiodraw使用.docx

http://www.CambridgeS/CambridgeShttp://www.ChemBioN/ChemBioNhttp://www.ChemBioF/ChemBioFhttp://www.SciS/SciSChemBioDraw和ChemBio3D中的NMR、IR光谱预测功能ChemBioDraw和ChemBio3D软件均包含NMR、IR光谱预测工具作者：Jesse Gordon 公司：CambridgeSoft 版本：19.2 　ChemBioDraw、ChemBio3D软件中均包含NMR(核磁共振图谱)和IR（红外）光谱预测工具。 文本将介绍NMR和IR预测工具的主要功能和预测方法。与本文相对应的还有一个录制好的视频文件，以实例演示使用技巧，实例中的样本均可下载供用户亲自实践。 　本文中涉及的主题： /articles/static/644Chinese.html?userid=1411719cid=684ChemNMR:在ChemBioDraw中预测1H-NMR和13C-NMR/articles/static/644Chinese.html?userid=1411719cid=684在ChemBioDraw中设置NMR参数/articles/static/644Chinese.html?userid=1411719cid=684ChemBio3D中光谱预测的设置/articles/static/644Chinese.html?userid=1411719cid=684GAMESS（从头计算量子化学程序）:在ChemBio3D中预测NMR、IR图谱　CambridgeSoft的ChemBio3D软件在程序编写时整合了多个计算化学包，NMR和IR预测模块就是已整合的计算化学包的一部分。这两个模块加上GAMESS和MOPAC均已整合到ChemBio3D软件中，无需另外付费。此外，ChemBio3D还为其他计算化学软件编写了接口，如Gaussian，Jaugar等。ChemBio3D还能够整合其它的计算化学包-如果有其他版本的NMR或IR光谱预测，CambridgeSoft会在未来的版本中将其囊括。在本文的结尾，附上对应的视频文件和ChemBio3D支持的计算化学包的介绍文章链接。 ChemNMR: 在ChemBioDraw中预测1H-NMR和13C-NMR　ChemNMR模块已整合在ChemBioDraw软件里 — 在绘制分子时候只需点击一个按键就能看到它的NMR图谱。要预测1H-NMR和13C-NMR图谱, 首先需要选定目标化学结构式，然后在Structure菜单选择Predict 1H-NMR Shifts或者Predict 13C-NMR Shifts 。ChemBioDraw根据预计的位移重绘一遍分子结构，显示出相关数据信息并在新的窗口中绘制出图谱。 图 1: （ChemBioDraw）选择要预测NMR图谱的结构式　在新窗口中执行NMR预测 (原来的分子式仍旧保留在初始窗口中)，新窗口中将标记以下内容：标记出每个氢原子的位移值（PPM）。显示带有耦合分裂（如果有的话）的NMR光谱。在图谱的下面列出相关的数字描述,有节点信息，位移值和用来帮助用户识别各个氢原子的注解。将鼠标移至分子中任意氢原子（内含氢）上，其在光谱中对应的峰以绿色高亮显示。反之，鼠标移至光谱中任意峰，对应的氢原子（内含氢）也会在分子结构式中以绿色高亮显示。（如果是密集峰，则会有不止一个氢原子被高亮显示)。图 2. ChemNMR显示出每个氢原子的位移值　当ChemNMR的预测质量比较一般时，位移值以粉红色显示，红色代表质量较低，蓝色则是质量较高的意思。如下例所示,阿司匹林, 酸式氢的预测质量不高，因此以红色显示。　ChemNMR以相对于TMS的PPM值评估位移,不能分配溶剂,因此属于无溶剂预测。一般，出现质量偏低或中等的结果是因为ChemNMR对特定氢的预测是依赖于溶剂造成的。图 3. 预测质量比较粗糙时位移值以粉红色或红色显示　Carbon-13 NMR预测方式类似于Proton-NMR。先选择分子，在Strcture菜单选择Predict 13C-NMR Shifts，然后ChemNMR预测位移，重绘分子，显示相关数据信息，并在新窗口显示光谱。Carbon-13 NMR光谱是以与四甲硅烷（TMS）的相对迁移值（PPM）来表示。图 4. Carbon-13 NMR工作方法与Proton-NMR相似在ChemBioDraw中设置NMR参数　ChemBioDraw的用户常常会问如何用不同的试剂做NMR预测-ChemNMR不支持试剂选择，但在ChemBio3D中的NMR预测是可以通过调节参数来实现试剂选择。　在ChemBioDraw中，分子的形状与