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共价键:肽键、二硫键 非共价键:氢键、离子键、疏水键、范德华力 是由两个半胱氨酸侧链的巯基-SH脱氢而形成的。 二硫键用于稳定蛋白质的三、四级高级构象。 多肽链中侧链间或侧链与主链骨架间所生成的氢键是维持蛋白质三、四级结构所需的 多肽链中主链骨架中的氢键是维持蛋白质二级结构主要的次级键 蛋白质中的疏水氨基酸残基避开水分子而聚集在分子内部的趋向力。 它是维持蛋白质分子三、四级结构最主要的作用力。 正、负电荷的侧链基团之间的一种静电吸引作用。 Ⅴ 范德华力 中性分子或中性原子之间弱的作用力,参与维持蛋白质分子三、四级结构 作业五 维持蛋白质一~四级结构的主要作用力分别是什么? ② 有机溶剂沉淀法: 常用与水互溶的有机溶剂如甲醇、乙醇、丙酮等,破坏水膜,使其沉淀。 ①重金属盐沉淀法 常用重金属盐有Hg2+盐、Pb2+盐、Cu2+盐等 ②生物碱试剂沉淀法 常用生物碱试剂如单宁酸、苦味酸、钨酸等 不可逆沉淀蛋白质的常用方法: 反应 试剂 颜色 反应基团 ★双缩脲反应 NaOH,稀CuSO4 紫红 2个或2个以上肽键 ★Folin酚试剂反应 CuSO4磷钨酸-钼酸 兰色 酚基 ★茚三酮反应 茚三酮 兰紫色 游离氨基 Millon反应 Millon试剂 红色 酚基 黄色反应 HNO3及NH3 黄、橘黄 苯环 乙醛酸反应 乙醛酸,H2SO4 紫红 色氨酸吲哚基 坂口反应 次氯酸钠,萘酚,NaOH 红色 精氨酸的胍基 蛋白质也有类似反应 红紫色络合物 (碱性溶液) Cu2+ 大部分蛋白质均含有芳香族氨基酸。 _______、_______、_________ 芳香族氨基酸在280nm 附近有最大吸收,绝大多数蛋白质也有同样的性质。 可以对蛋白质进行定性定量测定。 基本结构:一级结构 三维结构:高级结构 二级结构 超二级结构 结构域 三级结构 四级结构 一级结构决定高级结构,高级结构决定功能 1、定义: 指蛋白质分子中氨基酸的排列顺序和连接方式,它是实现蛋白质空间结构及其功能的基础,又称为蛋白质的化学结构、共价结构、初级结构 作业三:蛋白质一级结构的定义是什么? 蛋白质一级结构举例 牛胰核糖核酸酶 50年代末Moore等 牛胰岛素 1953年 sanger等 将肽链部分水解,生成的碎片(二肽、三肽等)用末端残基分析法加以测定。当有足够的小碎片被鉴定后,就有可能求出整个链中残基的顺序了。 1、 定义:指蛋白质多肽链主链的空间走向(折叠和盘绕方式) 2、四种二级结构单元 α-螺旋 β-折叠 β-转角 不规则卷曲 作业四:常见的蛋白质二级结构有哪几种? 俯视图 侧视图 ① 有右手螺旋及左手螺旋两种,天然蛋白质中的α-螺旋几乎都是右手螺旋,右手螺旋比左手的稳定 ② 稳定性是靠链内氢键维持的,肽链上C=O氧与它后面第4个残基上的N-H氢之间形成氢键,氢键的取向几乎与中心轴平行 ③ 每圈螺旋高度为0.54nm,含3.6个氨基酸残基;每个氨基酸残基绕轴旋转100°,沿轴上升0.15nm ④ 氨基酸残基的R侧链在螺旋的外侧,其形状、大小及电荷等均影响α-螺旋的形成 定义: 两条或多条几乎完全伸展的多肽链侧向聚集在一起,靠链间氢键联结的片层结构 ① 相邻肽链走向可平行也可反平行。肽链的N-端在同侧为平行式,不在同侧为反平行式。从能量角度考虑反平行式更为稳定 ② 稳定性是靠链间氢键维持的,氢键是由相邻肽链主链上的N-H和C=O之间形成的 ③ 氨基酸残基的R侧链交替分布在片层的上下两侧 定义:是蛋白质分子中出现的180°回折。 ①主链骨架以180°返回折叠 ②由多肽链上4个连续的氨基酸残基组成,第1个氨基酸残基的C=O与第4个氨基酸残基的N-H之间生成氢键 ④广泛存在于球状蛋白质中,多数由亲水氨基酸残基组成 定义:没有规律的多肽链主链骨架构象 此结构看来杂乱无章,但对一种特定蛋白又是确定的,而不是随意的。 酶的活性中心往往在无规则卷曲中。 若干相邻的二级结构单元组合在一起,彼此相互作用,形成有规则,在空间上能辨认的二级结构组合体。 补
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