5 蛋白质分子构象.pdf

第五章 蛋白质的空间结构 第一节 多肽链立体结构原理 第二节 二级结构 第三节 超二级结构 第四节 三级结构 第五节 四级结构 研究 1959年前，是结构较简单的各种纤维蛋白 对象 1959年后，是结构复杂的结晶球蛋白 纤维蛋白研究的主要途径是：建立机构模型，以解释纤维蛋白 的X-射线衍射图。 结晶球蛋白研究的主要途径是：制备合适的蛋白质单晶，同时 制备引入重金属原子的同晶型蛋白质单晶，记录并分析这两种 样品的X-射线衍射图，确定相位，绘出电子密度图，参考一级 结构，最后确定蛋白质空间结构。 第一节多肽链立体结构原理 一、肽单位平面结构 氨基酸残基 H O H H O H H O H H H N CαC N CαC N Cα C N CαCOOH 多肽链 2 R1 肽键 R2 R3 Rn 侧链 H1 H2 C α C N Cα C N Cα 1 1 1 2 2 2 3 多肽链主链骨架 O O 肽单位 肽单位的特征: 1.肽键具有部分双键的性质，不能自由旋转 C H C—N单键0.147nm C=N双键0.127nm .. C N 肽键中的C-N键约有40%双键性质， 0.1325nm 而C=O键约有40%单键性质。 O C 是酰胺N上的孤对电子与相邻羰基之间发生共振造成的。 2.肽单位是刚性平面结构 肽单位上的6个原子都位于同一个 刚性平面上。 3.肽单位有顺式和反式两种排布 Cα Cα Cα H C N C N O H O Cα 多肽链上大多数肽单位 顺式构型 反式构型 都是反式排布，因为反 式构型能量低。 O R H C R H RC H C N C 如果肽键是由一种氨基酸 C N O H C O O 与脯氨酸的亚氨基形成 反式 R 顺式 的，那麽这个肽键可能是 反式的，也可能是顺式的。 X-Pro之间的肽键 4.肽单位平面结构有一定的键长和键角 0.1325 肽单位平面结构 二、二面角