蛋白质组学与生物信息学.pdf

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2017-10-09 发布于湖北
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蛋白质组学与生物信息学

生物信息学培训蛋白质组学与生物信息学 Proteomics and Bioinformatics 孙瑞祥中科院计算所生物信息学实验室 rxsun@ 2013年5月13 日主要内容 1. 蛋白质组学简介 2. 质谱技术基础 3. 质谱数据分析方法 4. 质谱数据分析软件 5. 蛋白质鉴定软件评测 6. pFind实例分析 2 从iPRG-2010说起 ABRF: Association of Biomolecular Resource Facilities iPRG: Proteome Informatics Research Group 3 pFind(2) 以iPRG2010为例 Mascot (7) 4 同一个软件,不统一的结果为什么使用同样的软件(Mascot),有哪些信誉好的足球投注网站同一个数据库 (Human) 的相同质谱数据 (iPRG2010),却得到了如此差异的结果? －“人是驾驭数据(客体)的主体”: 如何分析质谱数据? 5 Matthias Mann: 比较分析 6 Matthias Mann: 谁赢了? 7 田中耕一: 质谱技术－多学科的交叉 8 8 质谱技术－多学科的交叉 9 9 质谱数据分析方法蛋白质鉴定问题多肽的碎裂与质谱数据特点数据库的检索方法检索结果的评价与过滤其他分析方法 10 蛋白质鉴定的“三步曲” 11 生物信息学－蛋白质鉴定的“高端” 12 蛋白质鉴定的基本流程 Excise spot