- 1、本文档共125页,可阅读全部内容。
- 2、有哪些信誉好的足球投注网站(book118)网站文档一经付费(服务费),不意味着购买了该文档的版权,仅供个人/单位学习、研究之用,不得用于商业用途,未经授权,严禁复制、发行、汇编、翻译或者网络传播等,侵权必究。
- 3、本站所有内容均由合作方或网友上传,本站不对文档的完整性、权威性及其观点立场正确性做任何保证或承诺!文档内容仅供研究参考,付费前请自行鉴别。如您付费,意味着您自己接受本站规则且自行承担风险,本站不退款、不进行额外附加服务;查看《如何避免下载的几个坑》。如果您已付费下载过本站文档,您可以点击 这里二次下载。
- 4、如文档侵犯商业秘密、侵犯著作权、侵犯人身权等,请点击“版权申诉”(推荐),也可以打举报电话:400-050-0827(电话支持时间:9:00-18:30)。
查看更多
第七章-旋光色散和园二色光谱
* * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * * [练习题]某蛋白质浓度为0.05 mg/ml,光径为10 mm,测得208 nm处的椭圆度值θ208的测量值为-102 m°(毫度),试计算208 nm处的平均残基椭圆度值和该蛋白质中α螺旋的含量。 Fasman等人还提出了?折叠含量的计算方法。其原则是根据[?]208计算出?螺旋,然后假设不同的?折叠的含量X?,并令 XH+ X?+ XR=1 其中XR是无规卷曲的含量。于是认为各不同波长时的[?]? 是各构象组分的贡献的加和。利用计算机算出各波长的[?]?,得出计算曲线。假设一些不同的X?值,分别求出它们相应的计算曲线,找出与实验曲线最接近的曲线。相应于该最接近曲线的X?及XR即认为是该蛋白质的相应结构的含量。此法被Fasman称为方法I。 为了改进计算精度,他们还利用计算机将公式及从方法I得到的X?及XR的数值反复修正,使最后的拟合曲线与实验曲线之差变得最小,于是得到更为可靠的XH、X?,及XR值。这种修正的方法被Fasman等称为方法II,其结果与X射线晶体结构的结果比较,?螺旋含量高的蛋白质数据比较好;对于?螺旋含量低,?结构含量较高的蛋白质,数据不够理想。 6.4.2.3用远紫外圆二色谱计算蛋白质的构象含量 ? Fasman等人的计算方法虽然结果比较满意,但是他所用的单一构象的参考数值及曲线来自多聚氨基酸。蛋白质是包括了多种氨基酸的、有特定顺序(即一级结构)的大分子,二者结构不同,因此Fasman所使用的参考数值能否用于蛋白质是一个疑问。如前述,以变性蛋白质的 CD谱与PLL无规卷曲的 CD谱比,两者有相当的不同,因此提出了解出蛋白质的参考曲线问题。 Saxena与Wetlaufer提出可以利用已解出晶体结构的蛋白质,算出它们的含量,然后测定这些蛋白质的远紫外CD谱,在这一基础上解出蛋白质在三种构象状态下的参考曲线。 首先他们假设,每一波长的椭圆值是三种构象在该波长的贡献的加和,即 ? 同时服从方程XH+ X?+ XR=1,[?]H,?、 [?]?,?及[?]R,?各是蛋白质的残基全部处于相应的构象时在该波长的椭圆值。XH、X?,及XR值可以由晶体结构解出。由于该方程式有三组未知数,即[?]H,?、[?]?,?及[?]R,?。因此只要有三个蛋白质,即可解出这三根参考曲线。 Wedlaufer等用肌红蛋白,溶菌酶及核糖核酸酶三个蛋白质的实验结果,算出了三根参考曲线,如下图中所示。图中同时列出了Fasman从PLL来的相应曲线。两组曲线相比,颇为相似。在蛋白质中,a螺旋的双负峰的位置也是222 nm及208 nm,但蛋白质的[?]222 比 PLL的[?]222 更负;从 ?折叠看,蛋白质的CD与PLL比较有显著不同,即负峰移到 220 nm,但 195 nm的正峰与?螺旋相似;对于无规卷曲讲,差异更显著,蛋白质的负峰移至192—193 nm处,其[?]只有PLL的三分之二,在222 nm处出现正峰,[?]222 相当于PLL的四倍。 和Wetlaufer等人差不多同时,Chen与 Yang提出了相类似的方法。他们假设,一个蛋白质分子内由三种构象成分组成,即?螺旋,?折叠和无规卷曲,并服从式XH+ X?+ XR=1假设。然后进一步假设,各个波长的[?]值由上述三种构象所共同组成,并且是它们的代数和,即有下列关系: ? 其中,[?]H,?、[?]?,?及[?]R,?各是蛋白质在全部残基都是?螺旋,?折叠及无规卷曲时波长是?时的[?]值。 根据一些多聚氨基酸的远紫外CD谱,他们假设,各种蛋白质当残基全部处于?螺旋,或?折叠,或无规卷曲时,相应的谱线都是相同的,即),[?]H,?、[?]?,?及[?]R,? 三根谱线能够适用于所有的蛋白质。这样,可以设法找到蛋白质的三种构象的标准参考曲线。 有了这些前提,他们就采用了与Wetlaufer相同的方法,即找到一些蛋白质,它们的晶体结构已经解出,它们的远紫外CD谱也已测定。对于这些蛋白质讲,可以从晶体结构中算出XH,i,X?,i及XR,i,此处i表示第i个蛋白质。还假设蛋白质在晶态时的构象与溶液态时的构象是一样的。这一假设从许多实验结果看,可以说近似地成立。 这样应该有 ? 其中, 在上式中,[?]?,i从圆二色仪中测出,[?]H,?、[?]?,?及
您可能关注的文档
- 生活中的立体图形1.ppt
- 生物学中的数学计算.ppt
- 生物:2.3《伴性遗传》课件(新人教版必修2).ppt
- 生物:3.1《DNA是主要的遗传物质》课件1(新人教版必修2).ppt
- 用Photoshop打造怀旧色调美女照片.pdf
- 用Photoshop调出金发美女梦幻色调.pdf
- 用Photoshop调出风光照片蓝紫色调.pdf
- 用于机载液晶显示的四基色发光二极管背光源.pdf
- 用地性质分类表.doc
- 用矿泉水瓶除蟑螂效果好又不杀生的方法.doc
- 2020版 沪科技版 高中生物学 必修2 遗传与进化《第4章 生物的进化》大单元整体教学设计[2020课标].docx
- 情绪价值系列报告:春节消费抢先看-国证国际证券.docx
- 精品解析:北京市东直门中学2023-2024学年高二下学期3月阶段性考试(选考)物理试题(解析版).docx
- 2020版 沪科技版 高中生物学 必修2 遗传与进化《第4章 生物的进化》大单元整体教学设计[2020课标].pdf
- 2020版 沪科技版 高中生物学 选择性必修1 稳态与调节《第1章 人体的内环境和稳态》大单元整体教学设计[2020课标].pdf
- 2020版 沪科技版 高中生物学 选择性必修1 稳态与调节《第1章 人体的内环境和稳态》大单元整体教学设计[2020课标].docx
- 液冷盲插快接头发展研究报告-全球计算联盟.docx
- 精品解析:北京市东直门中学2023-2024学年高二下学期3月阶段性考试(选考)物理试题(原卷版).docx
- 精品解析:北京市东直门中学2024届高三考前练习数学试卷(解析版).docx
- 2020版 沪科技版 高中生物学 选择性必修1 稳态与调节《第2章 人体的神经调节》大单元整体教学设计[2020课标].docx
文档评论(0)