结构域_31237.ppt

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结构域_31237

(一)结构域的概念 1 概念 2 独立折叠单位:蛋白质折叠单元 3 结构域与功能域: 4 大小:100-200个氨基酸残基 5 连接:单一肽链,类似铰链 6 结构域运动;蛋白分子柔韧性 (1)反平行? 螺旋结构域(全? -结构): ? -helix占主导 上下型螺旋束(up-and-down helix bundle) 如:四螺旋束,上下摆放, 轻微左手扭曲 珠蛋白型? -螺旋蛋白: 相邻的两螺旋接近相互垂直 含平行? 折叠片或?, ?混合结构。 ?折叠片两侧都分布有疏水侧链,常位于蛋白质的核心 单绕平行?桶或平行?桶:肽链按Rossman折叠方式单向卷绕而成的闭合式圆桶结构 反平行?-折叠片为主 反平行?-桶: ?-折叠片扭曲后围绕而成类似桶型的结构 希腊钥匙型: 超二级结构希腊钥匙闭合而成 果冻卷型(jell roll ?-barrel):伴刀豆凝集素A 上下型: ?-meander对合而成 开放式三明治(open-face sandwish)结构: 也称露面夹心, ?-折叠片上有一层?-螺旋,由回环连接,如细菌叶绿素蛋白 一般小于100aa残基 结构域不规则 很少量二级结构 富含金属或二硫键, 有稳定结构域作用 (三)多肽链折叠中的手性效应: 右手扭曲倾向: * * 一 结构域 (二)结构域分类: (2) 平行?, ?(或?/?)结构域: 双绕平行?片或马鞍形扭曲片:也称核苷酸结合结 构域。由 ?片扭曲成马鞍形,?-螺旋分处扭曲片的 两侧 N C (3)全 ? (反平行?) -结构域: 类型: (4)富含金属或二硫键 (小的不规则)结构域: N C

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