第一章_微生物的分类与鉴定(2学时).ppt

环 境 微 生 物 学 Environmental Microbiology 洪永聪 青岛农业大学生命科学学院 第一章 微生物的分类与鉴定（2学时） 一、微生物的分类 二、微生物的鉴定 三、微生物菌种的保藏 分类、鉴定与命名 分类（classification）：根据各种生物的相似性和进化关系将其分为类群，排放在适当的分类单元中 鉴定（identification）：是分类的操作过程，经过一系列测定来确定所研究的菌株属于哪个类群 命名（nomenclature）：根据命名的国际法规对所鉴定的菌株给以科学名称（学名） 一、微生物的分类 （一）微生物的分类单元 （二）微生物的命名 （三）微生物的分类方法 （四）微生物的分类系统 （一）微生物的分类单元 界 Kingdom 门 Phylum 纲 Class 目 Order 科 Family 属 Genus 种 Species ----------------------- 亚种 subspecies，subsp. 变型 variety，var. 1、种的概念 种（species）：微生物分类的基本单位；是指以某个“标准菌株”为代表的具有高度特征相似性的菌株群 菌株（strain）：是单个微生物细胞在人工培养基上繁殖而来的纯培养物；它是微生物分类和研究工作中最基本的操作实体 分离物（isolate）：是指已分离到但尚未鉴定的纯培养物 2、变型的概念 变型（ variety，var.）：是指微生物种以下，用某些特殊的特征加以区别的类群 血清变型（serovar）：表示抗原结构不同 生物变型（biovar）：表示特殊的生化或生理特征 致病变型（pathovar）：表示某专一致病性 噬菌体变型（phagovar）：表示对噬菌体的特异性反应 形态变型（morphovar）：表示特殊的形态特征 一、微生物的分类 （一）微生物的分类单元 （二）微生物的命名 （三）微生物的分类方法 （四）微生物的分类系统 （二）微生物的命名 一、微生物的分类 （一）微生物的分类单元 （二）微生物的命名 （三）微生物的分类方法 （四）微生物的分类系统 （三）微生物的分类方法 1、经典分类法 2、化学分类法 3、数值分类法 4、分子遗传学分类法 1、经典分类法 经典分类法（classic taxonomy）：最常用的微生物分类方法，以形态学特征、生理生化特征、生态学特征等为依据， 对微生物进行分类 科以上的分类以形态结构特征为主，而科以下则以其生理生化特性和生态学特征为主 2、化学分类法 化学分类法（chemotaxonomy）：根据微生物细胞结构或其代谢产物的化学组分分析结果，对微生物进行分类的方法，可作为微生物分类的辅助手段 分析方法：血清学检测、气相或液相色谱分析、质谱分析、凝胶电泳等 3、数值分类法 数值分类法（numerical taxonomy）：根据被鉴定的微生物与某类群之间的相似性而进行归类 程序：选择菌株和待测性状→ 性状编码（＋为1，－为0）→ 菌株间相似性计算→ 聚类分析（大于85%为同种，大于65%为同属） → 树状图或矩形图 4、分子遗传学分类法 分子遗传学分类法：根据遗传学指标（即遗传机制和生物大分子，如DNA、蛋白质等的组成）对微生物进行分类 项目：DNA的G+Cmol%分析、DNA-DNA杂交、DNA-rRNA杂交、16srRNA或18srRNA碱基序列分析等 一、微生物的分类 （一）微生物的分类单元 （二）微生物的命名 （三）微生物的分类方法 （四）微生物的分类系统 （四）微生物的分类系统 惠特克（Whittaker,1969）五界系统：动物界，植物界，原生生物界，真菌界，原核生物界 沃斯（Woese，1978）三域六界系统：采用寡核苷酸编目法，根据16SrRNA （或18SrRNA）的碱基序列分为3个域：真细菌域，古细菌域，真核生物域 八界系统 1989年，Cavalier Smith：提出了八界系统,即古细菌界、真细菌界、古真核生物界、原生动物界、藻界(Chromista)、植物界、真菌界和动物界 二、微生物的鉴定 （一）形态学特征测定 （二）生理生化特征测定 （三）血清学试验 （四）核酸的碱基序列分析 （五）蛋白质的氨基酸序列分析 （一）形态学特征测定 细胞的形态与结构：细胞的形态、大小与排列方式，细胞的结构与染色反应等 培养性状：菌落形态、斜面菌苔特征、液体培养特征等 二、微生物的鉴