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第三章 核酸的组成与结构
第三章 核酸的组成与结构 本章重点:DNA和RNA的组成、结构和功能。 本章难点:DNA结构的多态性。 二、DNA 的结构与功能 一级结构(Primary structure): 指DNA分子中核苷酸的排列顺序。 二级结构(Secondary structure): 双螺旋(double helix) 三股螺旋(triple helix) 三(高)级结构(Tertiary structure): 超螺旋(supercoil) 三、mRNA的具体结构与功能 1. 原核生物mRNA结构特点: (1)多顺反子(polycistron):一分子mRNA带有几种蛋白质的遗传信息,可以作为几种蛋白质的模板,能翻译出几种蛋白质。 (2) mRNA5′端无帽子结构,3 ′端一般无多聚A的尾巴。 (3)一般没有修饰碱基。 2. 真核生物mRNA结构的特点 (1)5 ′末端有帽子结构。 真核生物mRNA在转录后,在5’端加上帽子(7-甲基鸟嘌呤核苷),在蛋白质翻译时识别起始位置及防止被RNA酶降解。 (2)3′端多数带有多聚A的尾巴(polyadenylate tail),其长度为20~200个A. (3)分子中可能有修饰碱基,主要是甲基化。 (4)分子中有编码区与非编码区。 非编码区(untranslated region UTR)位于编码区的两端;5 ′非编码区有翻译起始信号。 四、tRNA:转运氨基酸 1.单链小分子,含73~93个核苷酸; 2.含有很多稀有碱基或修饰碱基,多为甲基化; 3.5 ′端总是磷酸化,且常是pG; 4.3 ′端为CCAOH; 5. 二级结构为三叶草形;6.三级结构为倒L型。 五、rRNA 1.核糖体的组成 3.原核生物rRNA的特点 (1)原核生物16SrRNA 的 3 ′端有一保守序列ACCUCCU,是mRNA的识别结合位点。 (2)原核生物5SrRNA的第43~47位核苷酸为CGAAC序列,可与tRNA上GTΨCG互补。 4.真核生物rRNA的特点 (1)真核生物5.8SrRNA上也有相同的CGAAC序列,是tRNA与rRNA相互识别、相互作用的部位。 (2)rRNA上有许多rRNA之间识别结合部位及蛋白质的相互作用部位。 六、核酶:有催化活性的RNA 1.核酶的发现 1982年,美国Thomas Cech 在研究四膜虫rRNA自我剪接时发现的;与此同时,加拿大的Sidney Altman 发现RNase P分子中的RNA组分有催化活性;1989年分享了Noble 化学奖。 2.核酶的发现意义 不仅拓宽了生物催化剂的领域,而且对RNA的生物学功能开创了一种历史性的新认识:RNA不仅具有储存和传递遗传信息的功能,而且还具有生物催化剂的功能,在一定程度上可以说,RNA一身兼有DNA和蛋白质两大类生物大分子的功能。 3.核酶的二级结构 核酶的二级结构对于催化活性很重要。Symons提出“锤头”状二级结构,三个螺旋区,13(或11)个保守核苷酸序列。 七、核内不均一RNA(hnRNA) 指真核细胞转录生成mRNA的前体;加工过程包括:5′加帽;3′端加尾;内含子的切除和外显子的拼接;分子内部的甲基化修饰作用;核苷酸序列的编辑作用。 八、小分子核内RNA(snRNA) 真核细胞核内一组小分子RNA,含70~300碱基,序列中尿嘧啶含量较高,因此又用U命名。既非任何RNA的前体,也非某种RNA代谢的中间产物,而是具有独特功能且独立存在的实体,参与mRNA的加工等多种功能。常与多种特异的蛋白质结合在一起,形成小分子核内核蛋白颗粒(small nuclear ribonucleoprotein particle,snRNP) 九、反义RNA 1.碱基序列正好与有意义mRNA互补的RNA,又称为调节RNA。 2.可与mRNA配对结合形成双链,最终抑制mRNA作为模板进行翻译。 3.还可作为DNA复制的抑制因子,与引物RNA互补结合抑制DNA复制,及在转录水平上与mRNA5′端互补,阻止RNA合成转录。 4.可以人工合成反义RNA来调节基因的表达,用于疾病治疗。 5.原核生物中也有一种mRNA干扰互补RNA(Mrna interfering complementary RNA,micRNA),也可与特异mRNA结合并阻止翻译。 第三节、核酸的提取 1.核酸的酚抽提 (1)原理:交替使用酚、氯仿两种蛋白质变性剂,更有效去除蛋白质。 (2)氯仿还可加速有机相与水相的分层。 (3)异戊醇:抑制界面泡沫的形成。 (4)标准程序:酚——酚-氯仿——氯仿。 2.核酸的沉淀 (1)原理:核酸与钠、钾、镁形成的盐在许多有机溶剂中不溶,
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