养心通脉有效部位方对大鼠骨髓间充质干细胞作用蛋白组学的生物.pdfVIP

世界科学技术—中医药现代化★中药研究 养心通脉有效部位方对大鼠骨髓间充质干细胞 作用蛋白组学的生物信息学分析＊ 1，2 ＊＊ 1 2 3 1 1 郑景辉 ，袁肇凯 ，黄龙坚 ，吴新正 ，简维雄 ，黄献平 ， 1 1 2 2 刘吉勇 ，曾　刚 ，王铁华 ，汤　亮 （1.湖南中医药大学中医诊断研究所　长沙　410007；2.广西中医药大学附属瑞康医院　南宁　530011； 3.湖南省第二人民医院　长沙　410007） 摘　要：目的：对养心通脉有效部位方（apr-YTF ）应用于骨髓间充质干细胞（BMSCs ）的作用蛋白组学 蛋白进行生物信息学分析。方法：根据核素标记相对和绝对定量（iTRAQ ）蛋白组学技术确定的apr-YTF 对BMSCs 作用靶点的差异蛋白，通过DAVID 数据库有哪些信誉好的足球投注网站软件结合GO 数据库有哪些信誉好的足球投注网站，进行注释和富集度分析， KEGG 数据库进行信号转导通路分析；VISANT 数据库检索蛋白质相互作用。结果：差异蛋白主要参与102 种生物学过程、35 种细胞组分、6 种分子途径，差异蛋白主要参与3 条信号转导通路，这些蛋白在3 条信 号转导通路上相互发生作用。结论：处于差异蛋白功能交互网中交叉点位置的Presenilin- 1、Presenilin-2 通过Notch 信号通路，Syntaxin-4 蛋白通过可溶性N- 乙基顺丁烯二酰亚胺敏感性的融合蛋白附着蛋白 （SNARE ）信号通路，丝裂原活化蛋白激酶12 （MAPK 12 ）通过MAPK 信号通路在apr-YTF 诱导BMSCs 向 心肌分化过程中发挥重要作用，养心通脉有效部位方对骨髓间充质干细胞的作用是在多位点、多环节、多种 生物学进程中发挥作用的，蛋白质组学生物信息学技术可以站在“整体观”的角度对中医药的作用机制作 出预测，结合分子生物学验证是一条很好的中医药现代化途径。 关键词：养心通脉有效部位方　骨髓间充质干细胞　蛋白质组学　生物信息学 doi: 10.11842/wst.20 14 .11.03 1　　中图分类号：R285.5　　文献标识码：A 骨 髓 间 充 质 干 细 胞 （Bone Marrow Mesenchy- 感 应 微 环 境 中外 源 刺 激 信 号 ，实 现 信 号 的跨 膜 转 mal Stem Cells ，BMSCs ）治疗 缺血性 心脏病 已经应 导 ，启 动 相 关 基 因 的表 达 而 向心 肌 细胞 、血 管 内皮 用 于 临床 ，这种治疗措施 可 以重建梗死组织丧失 的 细胞 、抑 或是成纤维 细胞 等方 向转化 。因此 了解微 心 肌 细胞 、改 善 缺 血 心 肌 功 能 ，具 有 良好 的临床 应 环境 信 号 在 BMSCs 细胞 膜 上 的靶 点及 转 导途 径对 用前景 ，已成 为 国内外心血管病研究领域 的热点[ 1] 。 进一 步 阐明其分化 、归巢机制并 控制其分化方 向具 BMSCs 在 此 病 理 级 联 反 应 中的作 用 实 际上 是 细胞 有重要意义 。本研究采用免疫蛋 白组学 的方法对养 心通 脉有 效 部 位 方应 用 于大 鼠 BMSCs 作 用靶 点进 　　　收稿日期：20 14-04-23 　　　修回日期：20 14-05-26 ＊　　 国家自然科学基金会青年项目）：养心通脉有效部位方对BMSCs 作用靶点及信号转导通路的研究，负责人：郑景辉；广西壮族自治 区科学技术厅科学研究与技术开发计划项目（桂科合 1347004-26 ）：基于系统生物学方法中药复方对BMSCs 作用靶点及转导通路的研究， 负责人：郑景辉；广西壮族自治区科学技术厅自然科学基金课题（20 13GXNSFAA0 19126 ）：基于免疫蛋白组学的养心通脉有效部位方对大鼠 BMSCs 作用靶点和信号转导通路的研究，负责人：郑景辉；